RNA–Protein interactions for RNA: YBR267W

REI1, Transcript of Cytoplasmic pre-60S factor, yeast

Gene REI1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REI1	YBR267W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	DON1	Q05610	365 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SPO75	Q07798	868 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GPM2	Q12008	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	HRT3	Q12347	344 aa		4.8	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	MTF2	P10849	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SPO12	P17123	173 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RAD16	P31244	790 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	TKL2	P33315	681 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YKR051W	P36142	418 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	PPS1	P38148	807 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ATG12	P38316	186 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	MED6	P38782	295 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	VFA1	P40080	203 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	NDC80	P40460	691 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	CHS6	P40955	746 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	HFM1	P51979	1187 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ERG5	P54781	538 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	UME1	Q03010	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GYL1	Q04322	720 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	TMN2	Q04562	672 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SML1	Q04964	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	EAF1	Q06337	982 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	MED1	Q12321	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	PPH22	P23595	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	MSH2	P25847	964 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	KIP1	P28742	1111 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	YHL008C	P38750	627 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	AIM46	P38885	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	NUP60	P39705	539 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	TOS3	P43637	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	ALT1	P52893	592 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	TOF2	Q02208	771 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	SPR28	Q04921	423 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	CDD1	Q06549	142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	BSP1	Q06604	576 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	VAC14	Q06708	880 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	GIS3	Q12418	502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
REI1	YBR267W	BI4	P03879	638 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	SIR1	P21691	654 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	RAD57	P25301	460 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	DPB3	P27344	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
REI1	YBR267W	KTR4	P38131	464 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	OSW5	P40219	148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	EFM4	P40516	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	YJR054W	P47114	497 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	BOP3	P53958	396 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	HER2	Q03557	464 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	PRM6	Q04705	352 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	APC5	Q08683	685 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	CHS1	P08004	1131 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	DAL7	P21826	554 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	APL1	P27351	700 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	SRB4	P32569	687 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	SWI3	P32591	825 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	YEL043W	P32618	956 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	FRE1	P32791	686 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	XRS2	P33301	854 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	DSE1	P40077	573 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	NUP84	P52891	726 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	MAL13	P53338	473 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	SEG1	Q04279	960 aa		4.76	□□□□□ -1.65
REI1	YBR267W	HPF1	Q05164	967 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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