RNA–Protein interactions for RNA: YML078W

CPR3, Transcript of Mitochondrial peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR3, Length 549 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR3	YML078W	PRE4	P30657	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	BEM3	P32873	1128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MRPL36	P36531	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	NPR3	P38742	1146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	YIR042C	P40586	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	SMK1	P41808	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	ERR3	P42222	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MCH5	Q08777	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	DIN7	Q12086	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	CHS3	P29465	1165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MTC7	P32633	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	SEG2	P34250	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	RRN3	P36070	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	BAP3	P41815	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	TAH11	P47112	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	UBA2	P52488	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	RIM8	P53179	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MDR1	P53258	950 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	AAD4	Q07747	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	RTP1	Q12751	981 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	ECM3	Q99252	613 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MET3	P08536	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	MCM10	P32354	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	OMA1	P36163	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	YNL195C	P40168	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	INP52	P50942	1183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	FDC1	Q03034	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	ARA2	Q04212	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	THI22	Q06490	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPR3	YML078W	URA3	P03962	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	IMP2'	P32351	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	GET2	P40056	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PUG1	P40100	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PIG2	P40187	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TMA108	P40462	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MNT3	P40549	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	IMA1	P53051	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	ERG5	P54781	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	NUC1	P08466	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PCK1	P10963	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	SEC12	P11655	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	POL3	P15436	1097 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	SLC1	P33333	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	NUP60	P39705	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	FKH2	P41813	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	GSM1	P42950	618 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	SAP4	P53036	818 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MRPS35	P53292	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	DLT1	Q04216	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	BIK1	P11709	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	ARG1	P22768	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PRP28	P23394	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CLB4	P24871	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	LYS9	P38999	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PSF2	P40359	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CTF18	P49956	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MTL1	P53214	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MEP3	P53390	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	ENT2	Q05785	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
CPR3	YML078W	RAD16	P31244	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	NTH1	P32356	751 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	JNM1	P36224	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	SFB3	P38810	929 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
CPR3	YML078W	UME6	P39001	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	FTR1	P40088	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	SRB7	P47822	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YDL183C	P48569	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	VPS64	Q03944	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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