RNA–Protein interactions for RNA: YLR187W

SKG3, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SKG3, Length 3,081 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG3	YLR187W	EXO70	P19658	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ERC1	P38767	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SAE2	P46946	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ERP6	P53198	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ALG12	P53730	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	TRE1	Q08919	783 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SLP1	Q12232	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	GIS3	Q12418	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PMS1	P14242	873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	AFG2	P32794	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PEX2	P32800	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	CSG2	P35206	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
SKG3	YLR187W	PRK1	P40494	810 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ZAP1	P47043	880 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ROD1	Q02805	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SPR28	Q04921	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	RRD2	Q12461	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	JIP3	O13555	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SWI6	P09959	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	REC107	P21651	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	DAL2	P25335	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	VAC17	P25591	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SIN4	P32259	974 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	TFC3	P34111	1160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	POP4	P38336	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	BEM4	P39011	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	NUT1	P53114	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	LIF1	P53150	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	TRM11	Q12463	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PCA1	P38360	1216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	MSR1	P38714	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	VAC8	P39968	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ALG5	P40350	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	CPR7	P47103	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	MIG2	P53035	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SPO19	Q03029	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ATP25	Q03153	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	GTB1	Q04924	702 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	AVL9	Q12500	764 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	COY1	P34237	679 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	NPP2	P39997	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	HUL5	P53119	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	RAD18	P10862	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	KAR4	P25583	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	CCL1	P37366	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	JEM1	P40358	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ARG2	P40360	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	PIN2	Q12057	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	MRPL25	P23369	157 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	COT1	P32798	439 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	AST1	P35183	429 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	TSC10	P38342	320 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	DYS1	P38791	387 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	TMN3	P40071	706 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SAD1	P43589	448 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	USE1	P53146	245 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	SPH1	Q06160	661 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	HDA3	Q06623	655 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	TAF3	Q12297	353 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SKG3	YLR187W	ECM29	P38737	1868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	CDC20	P26309	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	MRP4	P32902	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	TMA108	P40462	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	COG6	P53959	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	ECM3	Q99252	613 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SKG3	YLR187W	RRT12	P25381	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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