RNA–Protein interactions for RNA: YKL177W

YKL177W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL177W, Length 339 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL177W	YKL177W	URA3	P03962	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	HMG2	P12684	1045 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	SEC15	P22224	910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	RER1	P25560	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	YCL049C	P25577	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	XRS2	P33301	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	GET2	P40056	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	PUG1	P40100	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	RAD26	P40352	1085 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	MNT3	P40549	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	FKH2	P41813	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	ECL1	P48235	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	MDR1	P53258	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	NUC1	P08466	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	POL3	P15436	1097 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	PEX1	P24004	1043 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	CHS3	P29465	1165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	RRN3	P36070	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	OMA1	P36163	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	TAH11	P47112	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	ENT2	Q05785	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	MTF2	P10849	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	SIR1	P21691	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	ARG1	P22768	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	CLB4	P24871	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	CDS1	P38221	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	MTL1	P53214	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	MEP3	P53390	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	ERG5	P54781	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	THI22	Q06490	572 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	AAD4	Q07747	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	SLC1	P33333	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YKL177W	YKL177W	LYS9	P38999	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	FTR1	P40088	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	PSF2	P40359	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	TMA108	P40462	946 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	YDL183C	P48569	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	INP52	P50942	1183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	ACS1	Q01574	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	CRD1	Q07560	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	ENB1	Q08299	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	AIM41	Q12032	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	SOD2	P00447	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	LST4	P34239	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	SEG2	P34250	1132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	YIR042C	P40586	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	BAP3	P41815	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	GSM1	P42950	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	BNA1	P47096	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	AMA1	P50082	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YKL177W	YKL177W	PCK1	P10963	549 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	TUP1	P16649	713 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	RIT1	P23796	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	YBR138C	P38277	524 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	COS111	P38308	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	SFB3	P38810	929 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	NUP60	P39705	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	HOS4	P40480	1083 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	YIL077C	P40508	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	LAS17	Q12446	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	MET3	P08536	511 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	MRPL36	P36531	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	IFA38	P38286	347 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	EHT1	P38295	451 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	NPR3	P38742	1146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	FMO1	P38866	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	MUP1	P50276	574 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	RIM8	P53179	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	FDC1	Q03034	503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YKL177W	YKL177W	ARA2	Q04212	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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