RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W MIC19P43594 170 aa9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SKY1Q03656 742 aa9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W MDM38Q08179 573 aa9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W AIM39Q08223 395 aa9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PMS1P14242 873 aa9.31□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data9.31□□□□□ -0.92not detected
DDI1YER143W ADK2P26364 225 aa9.31□□□□□ -0.92
DDI1YER143W LTV1P34078 463 aa9.31□□□□□ -0.92
DDI1YER143W CCL1P37366 393 aa9.31□□□□□ -0.92
DDI1YER143W HMT1P38074 348 aa9.31□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SWC5P38326 303 aa9.31□□□□□ -0.92
DDI1YER143W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
DDI1YER143W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
DDI1YER143W CDC8P00572 216 aa9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W TUB3P09734 445 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W MSD1P15179 658 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SRB2P34162 210 aa9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W WHI3P34761 661 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SHE3P38272 425 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PCA1P38360 1216 aa9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W MSG5P38590 489 aa9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SAK1P38990 1142 aa9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W TMA108P40462 946 aa9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YJL045WP47052 634 aa9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W APM4Q99186 491 aa9.3□□□□□ -0.92
DDI1YER143W RFS1P38234 210 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W KHA1P40309 873 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W ARG2P40360 574 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YIL054WP40524 105 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YFL052WP43551 465 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PFD1P46988 109 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W INP52P50942 1183 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W CDC55Q00362 526 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SDH5Q08230 162 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W CIR2Q08822 631 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W APL5Q08951 932 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W GPM2Q12008 311 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YKL068W-AQ3E826 78 aa9.29□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PBS2P08018 668 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W AEP2P22136 580 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W LRE1P25579 583 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W TKL2P33315 681 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W TIF5P38431 405 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W RAD55P38953 406 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W ERP2P39704 215 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W AVT2P39981 480 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PRK1P40494 810 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YNL108CP53929 270 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W TAF9Q05027 157 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W THI7Q05998 598 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YDR018CQ12185 396 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W VPS5Q92331 675 aa9.28□□□□□ -0.92
DDI1YER143W TAO3P40468 2376 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YPK1P12688 680 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PEP5P12868 1029 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W GPI10P30777 616 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W NFU1P32860 256 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W GCS1P35197 352 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W MUD2P36084 527 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data9.27□□□□□ -0.93not detected
DDI1YER143W APN2P38207 520 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W SIF2P38262 535 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W NMD3P38861 518 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W LYS9P38999 446 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YMR134WP40207 237 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W MVP1P40959 511 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W ADA2Q02336 434 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PNG1Q02890 363 aa9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
DDI1YER143W HIP1P06775 603 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YML002WP0CF17 737 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YCR015CP25616 317 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PEX2P32800 271 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W ECM2P38241 364 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W HSL7P38274 827 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W FHL1P39521 936 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W MKT1P40850 830 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W ALY2P47029 1046 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YML6P51998 286 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W DDC1Q08949 612 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W ACM1Q08981 209 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W NBP2Q12163 236 aa9.26□□□□□ -0.93
DDI1YER143W ATP1P07251 545 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W NUD1P32336 851 aa9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W PLC1P32383 869 aa9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W OLA1P38219 394 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W VHC1P38329 1120 aa9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W FLC2P39719 783 aa9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W SAW1P39735 261 aa9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W NUT1P53114 1132 aa9.25□□□□□ -0.93
DDI1YER143W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.6 ms