RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A UFO1Q04511 668 aa3.79□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A STO1P34160 861 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A YEL1P34225 687 aa3.78□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A YKR018CP36114 725 aa3.78□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A ATG36P46983 293 aa3.78□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A YGL117WP53133 265 aa3.78□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A FRE7Q12333 620 aa3.78□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A HSL7P38274 827 aa3.77□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A HUL5P53119 910 aa3.77□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A GAL11P19659 1081 aa3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A SEC15P22224 910 aa3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A MRPL9P31334 269 aa3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A MSS1P32559 526 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A APN2P38207 520 aa3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A SET2P46995 733 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A SNF12P53628 566 aa3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A CPR8P53728 308 aa3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.76□□□□□ -1.81not detected
YHL009W-AYHL009W-A ARP4P80428 489 aa3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A POM34Q12445 299 aa3.76□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A ELF1P36053 145 aa3.75□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A COS111P38308 924 aa3.75□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A GDH3P39708 457 aa3.75□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A NHX1Q04121 633 aa3.75□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A YFT2Q06676 274 aa3.75□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A TUP1P16649 713 aa3.74□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A CAF16P43569 289 aa3.74□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A NMD5P46970 1048 aa3.74□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A PRS5Q12265 496 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A PXL1P36166 706 aa3.73□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A TRS23Q03784 219 aa3.73□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A CIT2P08679 460 aa3.72□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A MIH1P23748 554 aa3.72□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A RIM4P38741 713 aa3.72□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A SPC97P38863 823 aa3.72□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A CCT4P39078 528 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A IZH3Q07959 543 aa3.72□□□□□ -1.81
YHL009W-AYHL009W-A CDC9P04819 755 aa3.71□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A PMA2P19657 947 aa3.71□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A TSR4P25040 408 aa3.71□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A PCI8P40512 444 aa3.71□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A SNO3P43544 222 aa3.71□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A YJL049WP47048 450 aa3.71□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A JHD1P40034 492 aa3.7□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A MNT3P40549 630 aa3.7□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A THI6P41835 540 aa3.7□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A LSC1P53598 329 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A RSC9Q03124 581 aa3.7□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A LEU2P04173 364 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A HEM1P09950 548 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A KIN82P25341 720 aa3.69□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A ASK1P35734 292 aa3.69□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A MNN4P36044 1178 aa3.69□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A PIH1P38768 344 aa3.69□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A ZPS1Q12512 249 aa3.69□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A HOG1P32485 435 aa3.68□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A GCS1P35197 352 aa3.68□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A YHR202WP38887 602 aa3.68□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A MAF1P41910 395 aa3.68□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A RPC34P32910 317 aa3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A APD1P38281 316 aa3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A DOT6P40059 670 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A BIT61P47041 543 aa3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A YJL043WP47053 257 aa3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A MAL11P53048 616 aa3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A VHS3Q08438 674 aa3.67□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A AQY1P0CD91 305 aa3.66□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A URE2P23202 354 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A GSY1P23337 708 aa3.66□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YHL009W-AYHL009W-A FRS1P15624 595 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A YPT7P32939 208 aa3.65□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A MDM12Q92328 271 aa3.65□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A CPA2P03965 1118 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A DSS1P39112 969 aa3.64□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A NUP53Q03790 475 aa3.64□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A PET127P32606 800 aa3.63□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A YJR039WP47107 1121 aa3.63□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A CRC1Q12289 327 aa3.63□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A YPR089WO13585 888 aa3.62□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A ERR1P0CX10 437 aa3.62□□□□□ -1.83
YHL009W-AYHL009W-A ERR2P0CX11 437 aa3.62□□□□□ -1.83
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