RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 YML002WP0CF17 737 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 HIS2P38635 335 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 IRC6P43615 237 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YJR039WP47107 1121 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RIM21P48565 533 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YGR021WP53212 290 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 COS6P53344 381 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PMD1P32634 1753 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 HSF1P10961 833 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 CLN3P13365 580 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RET1P22276 1149 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PTC3P34221 468 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RRT2P38332 387 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 TIF5P38431 405 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 IML2P47031 731 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 FAL1Q12099 399 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 MDE1P47095 244 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 CDC53Q12018 815 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 FLO1P32768 1537 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 CLB2P24869 491 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YCR051WP25631 222 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 EXO5P38289 585 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SUL1P38359 859 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SUP45P12385 437 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SSP1P38871 571 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PXA1P41909 870 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 TDA10P42938 290 aa10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 ADE2P21264 571 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 NCA2Q12374 616 aa9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 REP1P03871 373 aa9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 EFT1P32324 842 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 KTR2P33550 425 aa9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YKR078WP36158 585 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 VPS16Q03308 798 aa9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YDR179W-AQ03983 463 aa9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 VIK1Q12045 647 aa9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 VPS45P38932 577 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 DAN4P47179 1161 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 BUL2Q03758 920 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 BCH2P36122 765 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PGM2P37012 569 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 NMD3P38861 518 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RIC1P40395 1056 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 MKT1P40850 830 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YFL066CP43538 392 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SSN8P47821 323 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SRM1P21827 482 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PRE8P23639 250 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PAT1P25644 796 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 UTP18P40362 594 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 BRE2P43132 505 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 ALB1P47019 175 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SEC10Q06245 871 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 ARR2Q06597 130 aa9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 CDC31P06704 161 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 MAK16P10962 306 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 CHS2P14180 963 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 CBF1P17106 351 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SPS22P25380 463 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 BUD23P25627 275 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 MRF1P30775 413 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SMI1P32566 505 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 NCL1P38205 684 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 UBP15P50101 1230 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 TDA9Q04545 1251 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 TAF10Q12030 206 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 CKA2P19454 339 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 BLI1P35727 113 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 DYS1P38791 387 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YMR187CQ03236 431 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PMT7Q06644 662 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SMC5Q08204 1093 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RIO1Q12196 484 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SPS1P08458 490 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 HMG1P12683 1054 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SNA3P14359 133 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SMY1P32364 656 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 BOL3P39724 118 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SDS3P40505 327 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YMR018WQ04364 514 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 DON1Q05610 365 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YLR297WQ05899 129 aa9.97□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data9.97□□□□□ -0.81not detected
RDN25-2RDN25-2 CLN2P20438 545 aa9.96□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PWP2P25635 923 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SBA1P28707 216 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PRR1P28708 518 aa9.96□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 AST2P39945 430 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 CWC25P53854 179 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 ULP1Q02724 621 aa9.96□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 MED1Q12321 566 aa9.96□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 GIP1P38229 639 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.3 ms