RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0297	Q0297	DAL1	P32375	460 aa		18.33	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	RRN6	P32786	894 aa		18.33	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	DUG2	P38149	878 aa		18.33	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	FHL1	P39521	936 aa		18.33	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	STR2	P47164	639 aa		18.33	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	YBR225W	P38321	900 aa		18.32	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	OPY2	Q06810	360 aa		18.32	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	APC5	Q08683	685 aa		18.32	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	EMP46	Q12396	444 aa		18.32	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	DSS4	P32601	143 aa		18.31	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	TAF9	Q05027	157 aa		18.31	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	AEP2	P22136	580 aa		18.3	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	YKL050C	P35736	922 aa		18.3	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	NUP60	P39705	539 aa		18.3	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	STU2	P46675	888 aa		18.3	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	HRD3	Q05787	833 aa		18.3	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	MRP4	P32902	394 aa		18.29	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	ATG3	P40344	310 aa		18.29	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	BSP1	Q06604	576 aa		18.29	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	RGR1	P19263	1082 aa		18.28	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	PUS2	P53167	370 aa		18.28	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	IRC10	Q08118	586 aa		18.28	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	KAR3	P17119	729 aa		18.27	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	SGF29	P25554	259 aa		18.27	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	TDA3	P38758	523 aa		18.27	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	SSP1	P38871	571 aa		18.27	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
Q0297	Q0297	STE11	P23561	717 aa		18.26	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	ISF1	P32488	338 aa		18.26	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	YBR053C	P38235	358 aa		18.26	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	YDR222W	Q04925	415 aa		18.26	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	APL4	Q12028	832 aa		18.26	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	BI2	P03873	423 aa		18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	BI4	P03879	638 aa		18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	PPH22	P23595	377 aa		18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	YGR111W	P53265	400 aa		18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	ERG5	P54781	538 aa		18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	YPL062W	Q02781	134 aa		18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	BI3	Q9ZZW7	517 aa		18.25	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	SIR1	P21691	654 aa		18.24	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	SRB2	P34162	210 aa		18.24	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	SFB2	P53953	876 aa		18.24	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	MTF2	P10849	440 aa		18.23	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	SNZ3	P43545	298 aa		18.23	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	SNZ2	P53824	298 aa		18.23	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	YHM2	Q04013	314 aa		18.23	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	AIM39	Q08223	395 aa		18.23	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	THI20	Q08224	551 aa		18.23	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	ARP7	Q12406	477 aa		18.23	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	MCM2	P29469	868 aa		18.22	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	HSP78	P33416	811 aa		18.22	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.22	■□□□□ 0.51	not detected
Q0297	Q0297	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	MED6	P38782	295 aa		18.21	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	PSY2	P40164	858 aa		18.21	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	PRK1	P40494	810 aa		18.21	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	FAP1	P53971	965 aa		18.21	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	GYL1	Q04322	720 aa		18.21	■□□□□ 0.51
Q0297	Q0297	HIS5	P07172	385 aa		18.2	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	HSL7	P38274	827 aa		18.2	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	TMN2	Q04562	672 aa		18.2	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	YCG1	Q06680	1035 aa		18.2	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	YRR1	Q12172	810 aa		18.2	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	PUT4	P15380	627 aa		18.19	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	SAP185	P40856	1058 aa		18.19	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	YGR021W	P53212	290 aa		18.19	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	TUB4	P53378	473 aa		18.19	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	VPS38	Q05919	439 aa		18.19	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	CLC1	P17891	233 aa		18.18	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	YER189W	P40104	122 aa		18.18	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	UFE1	P41834	346 aa		18.18	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	PMT7	Q06644	662 aa		18.18	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	VPS5	Q92331	675 aa		18.18	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	ATG12	P38316	186 aa		18.17	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	OSW7	P43611	510 aa		18.17	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	JJJ1	P53863	590 aa		18.17	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
Q0297	Q0297	YMR018W	Q04364	514 aa		18.17	■□□□□ 0.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.8 ms