RNA–Protein interactions for RNA: Q0115

BI3, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase, yeast

Gene BI3, Length 1,554 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI3	Q0115	VHS3	Q08438	674 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	SGO1	Q08490	590 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	YPR027C	Q12079	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	CDC26	P14724	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	PPZ2	P33329	710 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	YJR008W	P47085	338 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	RIA1	P53893	1110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	YNL034W	P53963	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	YNL018C	P53976	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	SND1	Q04007	877 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	STP4	Q07351	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	BNR1	P40450	1375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	GRX7	P38068	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	BIT2	P38346	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	FMO1	P38866	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	BAP3	P41815	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	TAH11	P47112	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	TGL2	P54857	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	SKY1	Q03656	742 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BI3	Q0115	CDC43	P18898	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	KIN3	P22209	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	BCD1	P38772	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	IES1	P43579	692 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
BI3	Q0115	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	HXT4	P32467	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	PET127	P32606	800 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	YPT7	P32939	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
BI3	Q0115	DUN1	P39009	513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	YOL057W	Q08225	711 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	ATG11	Q12527	1178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	MPD2	Q99316	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	NUP60	P39705	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	SNM1	P40993	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	BUD8	P41698	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	BIT61	P47041	543 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	UBC11	P52492	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	SPC105	P53148	917 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	THI22	Q06490	572 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	HIR1	P32479	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	KAR1	P11927	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	PEX1	P24004	1043 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	SFB3	P38810	929 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	EAF5	P39995	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	PHM6	Q05637	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	FMP52	P40008	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	ATG36	P46983	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	SSL2	Q00578	843 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	POM34	Q12445	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	BCS1	P32839	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	SEC6	P32844	805 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	FLO10	P36170	1169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	YIL077C	P40508	320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	SLD3	P53135	668 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BI3	Q0115	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	YHR033W	P38690	423 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	PXA1	P41909	870 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	RFX1	P48743	811 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	TAF4	P50105	388 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	TEL2	P53038	688 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	IMO32	P53219	342 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	MLH3	Q12083	715 aa		4.53	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	PRE4	P30657	266 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	DGR2	P32330	852 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	MTC7	P32633	139 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	PHO11	P35842	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	PHO12	P38693	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	PEA2	P40091	420 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	YIL166C	P40445	542 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	IRC5	P43610	853 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	PEX15	Q08215	383 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BI3	Q0115	SLX4	Q12098	748 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms