RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
BRR1YPR057W PRP9P19736 530 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SFL1P20134 766 aa9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W EFB1P32471 206 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W BUD2P33314 1104 aa9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W NOP4P37838 685 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W TIF5P38431 405 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W CBR1P38626 284 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W NMD5P46970 1048 aa9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W VPS72Q03388 795 aa9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W UFO1Q04511 668 aa9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W CDD1Q06549 142 aa9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YPR027CQ12079 277 aa9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PCD1Q12524 340 aa9.89□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W CHS1P08004 1131 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PDR1P12383 1068 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PMS1P14242 873 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W GCD6P32501 712 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W MRP4P32902 394 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SEG2P34250 1132 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W UBX7P38349 436 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W TMN3P40071 706 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W MND1P53102 219 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YGR130CP53278 816 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W ULP1Q02724 621 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W IVY1Q04934 453 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W STE23Q06010 1027 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W CTF3Q12748 733 aa9.88□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W RAD1P06777 1100 aa9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W KAR3P17119 729 aa9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W ECM2P38241 364 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W QNS1P38795 714 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SAP1P39955 897 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SNZ3P43545 298 aa9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YJR039WP47107 1121 aa9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W INP52P50942 1183 aa9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W NOG2P53742 486 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SNZ2P53824 298 aa9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W RNT1Q02555 471 aa9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W ECM29P38737 1868 aa9.87□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W JIP3O13555 125 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W TUB3P09734 445 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W VBA3P25594 458 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W MSH1P25846 959 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W DRE2P36152 348 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W VBA5P36172 582 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W MSG5P38590 489 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PCM1P38628 557 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W APM2P38700 605 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W TVP23P38962 199 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W GEM1P39722 662 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YJR054WP47114 497 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data9.86□□□□□ -0.83not detected
BRR1YPR057W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SFH1Q06168 426 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W TRE1Q08919 783 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W MAM3Q12296 706 aa9.86□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W TRX1P22217 103 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data9.85□□□□□ -0.83not detected
BRR1YPR057W CYS3P31373 394 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PLC1P32383 869 aa9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W AGP2P38090 596 aa9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YBL036CP38197 257 aa9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PCA1P38360 1216 aa9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YHL026CP38740 315 aa9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W YMR134WP40207 237 aa9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W INP51P40559 946 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W GCV2P49095 1034 aa9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W TOM1Q03280 3268 aa9.85□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PEP5P12868 1029 aa9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PUT4P15380 627 aa9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W SAT4P25333 603 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W RSA4P25382 515 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W TBS1P38114 1094 aa9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data9.84□□□□□ -0.83not detected
BRR1YPR057W YML6P51998 286 aa9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W ARO80Q04052 950 aa9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W OMS1Q06668 471 aa9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W EMP46Q12396 444 aa9.84□□□□□ -0.83
BRR1YPR057W RAD10P06838 210 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W FUB1P25659 250 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W KDX1P36005 433 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SWC5P38326 303 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W VHC1P38329 1120 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W RGD1P38339 666 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W DSE1P40077 573 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W INA22P40576 216 aa9.83□□□□□ -0.84
BRR1YPR057W SAP185P40856 1058 aa9.83□□□□□ -0.84
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