RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A YMR124WP39523 943 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A FMP52P40008 231 aa0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A STV1P37296 890 aa0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YBR184WP38299 523 aa0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MEP2P41948 499 aa0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PPN1Q04119 674 aa0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A VBA4Q04602 768 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A DBP2P24783 546 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CDC12P32468 407 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A GCD7P32502 381 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A KTR2P33550 425 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A GCS1P35197 352 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A BCD1P38772 366 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A NCS6P53088 359 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PGK1P00560 416 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A KIN82P25341 720 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A AGP1P25376 633 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A UGP1P32861 499 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A RPC34P32910 317 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A GGA2P38817 585 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A IRR1P40541 1150 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A FAF1P40546 346 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A SLI1P53304 468 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ATG4P53867 494 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A TPO3Q06451 622 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A VHS3Q08438 674 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ATG11Q12527 1178 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CIT1P00890 479 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A SWC3P31376 625 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A RGT1P32862 1170 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YKR078WP36158 585 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A APD1P38281 316 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data0.87□□□□□ -2.27not detected
YPL060C-AYPL060C-A CRZ1P53968 678 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A REC102Q02721 264 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YDL073WQ07454 984 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A RIB2Q12362 591 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A WHI5Q12416 295 aa0.87□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MSD1P15179 658 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A APN1P22936 367 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A THI4P32318 326 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A STO1P34160 861 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PHO11P35842 467 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ERT1P38140 529 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PHO12P38693 467 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A TDA3P38758 523 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CCT4P39078 528 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MNT3P40549 630 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ASN1P49089 572 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ASI2P53895 289 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A VPS16Q03308 798 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CHS5Q12114 671 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MNL2Q12205 849 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A AHA1Q12449 350 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A LAM4P38800 1345 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A NUP145P49687 1317 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CRP1P38845 465 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A RAD26P40352 1085 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A SCW4P53334 386 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A DIP5P53388 608 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A FCP1Q03254 732 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A SUI3P09064 285 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PPG1P32838 368 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A RPT3P33298 428 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A VPS25P47142 202 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A LRS4Q04087 347 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A GRS2Q06817 618 aa0.86□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A BEM3P32873 1128 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CTF13P35203 478 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MRPL1Q04599 285 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A NDD1Q08887 554 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A HAL9Q12180 1030 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YOR111WQ99210 232 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A CDC6P09119 513 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A ELF1P36053 145 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A TYS1P36421 394 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A TY4A-JP47023 414 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A UBX6P47049 396 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YGL082WP53155 381 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A BUD7Q08754 746 aa0.85□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A DGR2P32330 852 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A TSL1P38427 1098 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A HLJ1P48353 224 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A UFO1Q04511 668 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A EMC3P36039 253 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PCI8P40512 444 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A OPT1P40897 799 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A OSW7P43611 510 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A MTL1P53214 551 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YHM2Q04013 314 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A PRS5Q12265 496 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A HER1Q12276 1246 aa0.84□□□□□ -2.27
YPL060C-AYPL060C-A YAP1P19880 650 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A YCL002CP25565 263 aa0.84□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A LOT5P34234 306 aa0.84□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A TMN3P40071 706 aa0.84□□□□□ -2.28
YPL060C-AYPL060C-A URM1P40554 99 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.28
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