RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	YDR476C	Q03362	224 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CCE1	Q03702	353 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	FUS2	Q05670	677 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	VIK1	Q12045	647 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GNT1	Q12096	491 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	DCS2	Q12123	353 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SAC3	P46674	1301 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MAS1	P10507	462 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RAD57	P25301	460 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ADD66	P36040	267 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GRX7	P38068	203 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	VHC1	P38329	1120 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ERP5	P38819	212 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GEM1	P39722	662 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PCI8	P40512	444 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	VID30	P53076	958 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	LSC2	P53312	427 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MGR3	Q04472	501 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	DON1	Q05610	365 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ATP4	P05626	244 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CLN3	P13365	580 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PRE8	P23639	250 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	KAR4	P25583	335 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TGL4	P36165	910 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MRPL40	P36534	297 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YHL008C	P38750	627 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	VPS25	P47142	202 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TOM22	P49334	152 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	HFM1	P51979	1187 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GUP1	P53154	560 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
RRP5	YMR229C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	KRE2	P27809	442 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PIH1	P38768	344 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GIC1	P38785	314 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	AIM20	P40451	204 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YJL132W	P47014	750 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YJL049W	P47048	450 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YPL109C	Q02981	657 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	HOT1	Q03213	719 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YDL121C	Q07541	149 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TRE2	Q08693	809 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TFB4	Q12004	338 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ALG1	P16661	449 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CKA2	P19454	339 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SEC66	P33754	206 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	HXT5	P38695	592 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NHP10	Q03435	203 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ADY4	Q05955	493 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	LDB17	Q12342	491 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CDC34	P14682	295 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ERT1	P38140	529 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TRM5	P38793	499 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TAF6	P53040	516 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TIM8	P57744	87 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	AAD4	Q07747	329 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YLR053C	Q12026	108 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ULA1	Q12059	462 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	FRT1	Q99332	602 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	INO1	P11986	533 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YKR075C	P36155	307 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	KTR4	P38131	464 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	IRR1	P40541	1150 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TFB2	Q02939	513 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CDC6	P09119	513 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PMR1	P13586	950 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TYR1	P20049	452 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	STE11	P23561	717 aa		3.43	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SGE1	P33335	543 aa		3.43	□□□□□ -1.86

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