RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	COT1	P32798	439 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	SEC8	P32855	1065 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.98	□□□□□ -1.29	not detected
MIA40	YKL195W	UBX7	P38349	436 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	TDA3	P38758	523 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	MIC19	P43594	170 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	NET1	P47035	1189 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	RPC17	P47076	161 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	TAM41	P53230	385 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	YGR125W	P53273	1036 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	RNT1	Q02555	471 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	URH1	Q04179	340 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	OMS1	Q06668	471 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	SLX4	Q12098	748 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	ERP3	Q12403	225 aa		6.98	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	KIP1	P28742	1111 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	CBF2	P32504	956 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	EXO5	P38289	585 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	VPS41	P38959	992 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	SPC72	P39723	622 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	YEL025C	P39991	1188 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	AVT1	P47082	602 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	GYL1	Q04322	720 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	ECI1	Q05871	280 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	SYT1	Q06836	1226 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	GPI13	Q07830	1017 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	RMP1	Q12530	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
MIA40	YKL195W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RAD1	P06777	1100 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	CYT1	P07143	309 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	DEP1	P31385	405 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	EUG1	P32474	517 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	EAF5	P39995	279 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	MDR1	P53258	950 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RTT102	P53330	157 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	VTC3	Q02725	835 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	ROD1	Q02805	837 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YPQ2	Q06328	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YLR462W	O13556	202 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	TFC4	P33339	1025 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	SLD2	P34252	453 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RCK2	P38623	610 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YHL049C	P38722	271 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	SAK1	P38990	1142 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YEL075C	P39972	122 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YER189W	P40104	122 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YFL064C	P43540	174 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	EEB1	Q02891	456 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	STE23	Q06010	1027 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	IES4	Q08561	116 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	AIM41	Q12032	185 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YLL058W	Q12198	575 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	SPO21	Q12411	609 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		6.95	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	SWI3	P32591	825 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RRN6	P32786	894 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	MDJ1	P35191	511 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	MRX3	P38172	270 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RRT2	P38332	387 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RGD1	P38339	666 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	HIS2	P38635	335 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	NPP2	P39997	493 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	YTA12	P40341	825 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RAD26	P40352	1085 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.94	□□□□□ -1.3	not detected
MIA40	YKL195W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	BRO1	P48582	844 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	SHE10	P53075	577 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	MRS2	Q01926	470 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	COQ9	Q05779	260 aa		6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	CLB1	P24868	471 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	DAL2	P25335	343 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	MSH1	P25846	959 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	DBF4	P32325	704 aa		6.93	□□□□□ -1.3
MIA40	YKL195W	IRE1	P32361	1115 aa		6.93	□□□□□ -1.3

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