RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	EAR1	Q03212	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	OMS1	Q06668	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CKA1	P15790	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PHO3	P24031	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NPP1	P25353	742 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ERG3	P32353	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DAL1	P32375	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SEC61	P32915	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	FAT1	P38225	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YIL092W	P40497	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DJP1	P40564	432 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CIR1	P42940	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SPO74	P45819	413 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TRM8	Q12009	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	IOC2	Q12072	812 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SFI1	Q12369	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	STF1	P01098	86 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NUC1	P08466	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PMS1	P14242	873 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SLS1	P42900	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PPT1	P53043	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SSL2	Q00578	843 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CBF2	P32504	956 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NPR2	P39923	615 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	VNX1	P42839	908 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YNR040W	P53736	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MFB1	Q04922	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	SDS22	P36047	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	VRP1	P37370	817 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	YHR202W	P38887	602 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	PUG1	P40100	303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	MAD3	P47074	515 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	NIT3	P49954	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	FCP1	Q03254	732 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	DCS2	Q12123	353 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
SYF1	YDR416W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	SEC65	P29478	273 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	YJL068C	P40363	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	HXT16	P47185	567 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	SAP4	P53036	818 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	ZDS2	P54786	942 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	VTH1	P40438	1549 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	VTH2	P40890	1549 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	REC107	P21651	314 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	ADP1	P25371	1049 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	SGF29	P25554	259 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	NPR3	P38742	1146 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	YLF2	P38746	405 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	RIP-Chip
SYF1	YDR416W	CTF18	P49956	741 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	REX3	Q12090	404 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	PTC5	Q12511	572 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	MYO4	P32492	1471 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	MDL1	P33310	695 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	CNS1	P33313	385 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	YJR124C	P47159	448 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
SYF1	YDR416W	HOT1	Q03213	719 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	CBP3	P21560	335 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	KIP1	P28742	1111 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	IFA38	P38286	347 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	EAF5	P39995	279 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	SPP41	P38904	1435 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SYF1	YDR416W	MET17	P06106	444 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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