RNA–Protein interactions for RNA: YDR243C

PRP28, Transcript of RNA helicase in the DEAD-box family, yeast

Gene PRP28, Length 1,767 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP28	YDR243C	VPS16	Q03308	798 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MLH2	Q07980	695 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	APL4	Q12028	832 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	ICL2	Q12031	575 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	ARP6	Q12509	438 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	BNR1	P40450	1375 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SPS1	P08458	490 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	YME1	P32795	747 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	AFR1	P33304	620 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	BAP2	P38084	609 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RRM3	P38766	723 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RRF1	P38771	230 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SSN3	P39073	555 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RPH1	P39956	796 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MXR1	P40029	184 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	KTR7	P40504	517 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	VTC4	P47075	721 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SPC105	P53148	917 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SPO1	P53541	631 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	INA17	Q02888	182 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	WAR1	Q03631	944 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SEC10	Q06245	871 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	DXO1	Q06349	442 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SIR4	P11978	1358 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	CDC25	P04821	1589 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SWI5	P08153	709 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	CKI1	P20485	582 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MEF1	P25039	761 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	DAL1	P32375	460 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	CNS1	P33313	385 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	CPR5	P35176	225 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SDH8	P38345	138 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	YHI9	P38765	294 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	JLP2	P40206	208 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	PCI8	P40512	444 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	LYS14	P40971	790 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	ROG3	P43602	733 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	STB4	P50104	949 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	LIF1	P53150	421 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	HXT17	P53631	564 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MEC3	Q02574	474 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	TSC13	Q99190	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SEY1	Q99287	776 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SNT2	P53127	1403 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	GPA2	P10823	449 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	SNA3	P14359	133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	ALG1	P16661	449 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	ANP1	P32629	500 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MRPL17	P36528	281 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	CCL1	P37366	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MAL33	P38157	468 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	RIM11	P38615	370 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	OSH7	P38755	437 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	BUD16	P39988	312 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRP28	YDR243C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66

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