RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0297	Q0297	YNL011C	P53980	444 aa		18.49	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	SLG1	P54867	378 aa		18.49	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	DYS1	P38791	387 aa		18.48	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	YNR014W	P53719	212 aa		18.48	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	RIM4	P38741	713 aa		18.47	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	MND1	P53102	219 aa		18.47	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	RAD59	Q12223	238 aa		18.47	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	MET4	P32389	672 aa		18.46	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	VFA1	P40080	203 aa		18.46	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	UME1	Q03010	460 aa		18.46	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
Q0297	Q0297	PEX34	P25584	144 aa		18.45	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	PPZ1	P26570	692 aa		18.45	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	RTT107	P38850	1070 aa		18.45	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	VPS70	P47161	811 aa		18.45	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	VPS75	P53853	264 aa		18.45	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	HER2	Q03557	464 aa		18.45	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	FMP25	Q08023	583 aa		18.45	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	YER152C	P10356	443 aa		18.44	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	TUP1	P16649	713 aa		18.44	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	TRE1	Q08919	783 aa		18.44	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	CDC27	P38042	758 aa		18.43	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	SAM3	Q08986	587 aa		18.43	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	JIP3	O13555	125 aa		18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	KEX2	P13134	814 aa		18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	PHO13	P19881	312 aa		18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	BET2	P20133	325 aa		18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	RAD55	P38953	406 aa		18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	TAD1	P53065	400 aa		18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	NSE5	Q03718	556 aa		18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	YOL098C	Q12496	1037 aa		18.42	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	MIC60	P36112	540 aa		18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	JNM1	P36224	373 aa		18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	YMC2	P38087	329 aa		18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	MMM1	P41800	426 aa		18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	PFD1	P46988	109 aa		18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	GYP6	P32806	458 aa		18.4	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	COY1	P34237	679 aa		18.4	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	EXO5	P38289	585 aa		18.4	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	DDC1	Q08949	612 aa		18.4	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
Q0297	Q0297	RAM1	P22007	431 aa		18.39	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	SFB3	P38810	929 aa		18.39	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	IES1	P43579	692 aa		18.39	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	PHO86	P46956	311 aa		18.39	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	GCN5	Q03330	439 aa		18.39	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	ARO80	Q04052	950 aa		18.39	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	NBP2	Q12163	236 aa		18.39	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	YKR051W	P36142	418 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	DSF2	P38213	736 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	HXT8	P40886	569 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	GUF1	P46943	645 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	ASG7	P46993	209 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	PML39	Q03760	334 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	YDR344C	Q05510	147 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	MDM38	Q08179	573 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	VPS54	Q12071	889 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	ATG9	Q12142	997 aa		18.38	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	YEL075C	P39972	122 aa		18.37	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	YAP5	P40574	245 aa		18.37	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	AVT2	P39981	480 aa		18.36	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	CDC1	P40986	491 aa		18.36	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	LSB6	P42951	607 aa		18.36	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	VTC4	P47075	721 aa		18.36	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	HOP2	P53187	214 aa		18.36	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	NDJ1	Q12366	352 aa		18.36	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	SPO12	P17123	173 aa		18.35	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	RAD16	P31244	790 aa		18.35	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	PXL1	P36166	706 aa		18.35	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	YBL036C	P38197	257 aa		18.35	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	YTA12	P40341	825 aa		18.35	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	HMI1	Q12039	706 aa		18.35	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	YKL097C	P34245	136 aa		18.34	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	BCH2	P36122	765 aa		18.34	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	YPQ1	Q12010	308 aa		18.34	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	CCH1	P50077	2039 aa		18.33	■□□□□ 0.53
Q0297	Q0297	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.9 ms