RNA–Protein interactions for RNA: YMR094W

CTF13, Transcript of Subunit of the CBF3 complex, yeast

Gene CTF13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTF13	YMR094W	ECM1	P39715	212 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	YAP1802	P53309	568 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	NSE3	Q05541	303 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	BNR1	P40450	1375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
CTF13	YMR094W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	GDH3	P39708	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	YJL206C	P39529	758 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	YIL166C	P40445	542 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	DMC1	P25453	334 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	MTL1	P53214	551 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	SIR3	P06701	978 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	MTC2	P34246	357 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	YHR112C	P38716	378 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	NDC80	P40460	691 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	NNF1	P47149	201 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	ORC4	P54791	529 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTF13	YMR094W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	SFB3	P38810	929 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	YFL052W	P43551	465 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	BNA2	P47125	453 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	TAF3	Q12297	353 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	MCD4	P36051	919 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	FLO10	P36170	1169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	FMO1	P38866	432 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	LYS9	P38999	446 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	IMO32	P53219	342 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	NUP60	P39705	539 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	CTR1	P49573	406 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	MAL11	P53048	616 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	NPY1	P53164	384 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ARO10	Q06408	635 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ADY2	P25613	283 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	APT2	P36973	181 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ARG2	P40360	574 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	MCM21	Q06675	368 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	EMP70	P32802	667 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	GLG1	P36143	616 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
CTF13	YMR094W	COQ11	Q05892	277 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	SPO11	P23179	398 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	UBS1	P38290	277 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	CAF16	P43569	289 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	CDC9	P04819	755 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	PHO11	P35842	467 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	PHO12	P38693	467 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	SNM1	P40993	198 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	FHN1	P53279	174 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ATG4	P53867	494 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	MDM12	Q92328	271 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CTF13	YMR094W	REC102	Q02721	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	MLH3	Q12083	715 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	MDM10	P18409	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	TIM23	P32897	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	YKR051W	P36142	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	BDH2	P39713	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	YEL020C	P39994	560 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	RPN13	O13563	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	GSY1	P23337	708 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	DSS1	P39112	969 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	GET2	P40056	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	RPN4	Q03465	531 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	NHX1	Q04121	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTF13	YMR094W	THI7	Q05998	598 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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