RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C ATG14P38270 344 aa7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C RRF1P38771 230 aa7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C DUN1P39009 513 aa7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C RMD8P43620 662 aa7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C SAE2P46946 345 aa7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C PUS4P48567 403 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YGR250CP53316 781 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C PTC5Q12511 572 aa7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C PGA3Q12746 312 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SHO1YER118C NUC1P08466 329 aa7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C DBP2P24783 546 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C LSM5P40089 93 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C FET4P40988 552 aa7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ROG3P43602 733 aa7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C MAD3P47074 515 aa7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C HXT16P47185 567 aa7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C CBK1P53894 756 aa7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C MFB1Q04922 465 aa7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C MDM38Q08179 573 aa7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SHO1YER118C NCP1P16603 691 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C UBC1P21734 215 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C SEC65P29478 273 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C SDS22P36047 338 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C TFA2P36145 328 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ARL1P38116 183 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C INP51P40559 946 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C IMA5P40884 581 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ALY2P47029 1046 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C GUP1P53154 560 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C CPR6P53691 371 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C BIO5P53744 561 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C TFC6Q06339 672 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C GYP1Q08484 637 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C DCS2Q12123 353 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C SFI1Q12369 946 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C DBP10Q12389 995 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C INO80P53115 1489 aa7.17□□□□□ -1.26
SHO1YER118C FUM1P08417 488 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C CKA1P15790 372 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C NAM7P30771 971 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YBR225WP38321 900 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YHR202WP38887 602 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YER010CP40011 234 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C PUG1P40100 303 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C CIR1P42940 261 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C LSB6P42951 607 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C SAP4P53036 818 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YNR065CP53751 1116 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YPL071CQ02864 156 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C EAR1Q03212 550 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YIG1Q08956 461 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C CEX1Q12453 761 aa7.16□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ADP1P25371 1049 aa7.15□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YJL181WP46987 611 aa7.15□□□□□ -1.26
SHO1YER118C ARE2P53629 642 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SHO1YER118C FCP1Q03254 732 aa7.15□□□□□ -1.26
SHO1YER118C YMR155WQ03795 547 aa7.15□□□□□ -1.26
SHO1YER118C TRM8Q12009 286 aa7.15□□□□□ -1.26
SHO1YER118C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SHO1YER118C PSF3Q12146 194 aa7.15□□□□□ -1.26
SHO1YER118C PMS1P14242 873 aa7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data7.14□□□□□ -1.27not detected
SHO1YER118C KIP1P28742 1111 aa7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C ERG3P32353 365 aa7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C YKL151CP36059 337 aa7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C EAF5P39995 279 aa7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C PTK2P47116 818 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C HRQ1Q05549 1077 aa7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C ESC8Q08119 714 aa7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C YPL260WQ08977 551 aa7.14□□□□□ -1.27
SHO1YER118C STF1P01098 86 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C VMA2P16140 517 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C GLK1P17709 500 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C OLE1P21147 510 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C SGF29P25554 259 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C CYS3P31373 394 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C CBF2P32504 956 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C TGL1P34163 548 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C TSL1P38427 1098 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C NPR2P39923 615 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C STL1P39932 569 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C SCS2P40075 244 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C SEC27P41811 889 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C SPO74P45819 413 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C CTF18P49956 741 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C VPS9P54787 451 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C SSL2Q00578 843 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C YDR131CQ03899 556 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C MCH5Q08777 521 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C SOG2Q08817 791 aa7.13□□□□□ -1.27
SHO1YER118C ADH4P10127 382 aa7.12□□□□□ -1.27
SHO1YER118C PRO1P32264 428 aa7.12□□□□□ -1.27
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