RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	CCC2	P38995	1004 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	HUL4	P40985	892 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	IES1	P43579	692 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	HUL5	P53119	910 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SVF1	Q05515	481 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	YPR078C	Q06813	372 aa		7.1	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SRD1	P09007	221 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	SWI6	P09959	803 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	CLN3	P13365	580 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	DAL7	P21826	554 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	UGA4	P32837	571 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	BYE1	P36106	594 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	EFM4	P40516	257 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	JJJ3	P47138	172 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	VID30	P53076	958 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	MAL13	P53338	473 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	DIP5	P53388	608 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	TOF1	P53840	1238 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	YML037C	Q03703	340 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	YPL277C	Q08989	487 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	GIN4	Q12263	1142 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	OSH2	Q12451	1283 aa		7.09	□□□□□ -1.27
MIA40	YKL195W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	RAD57	P25301	460 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	JNM1	P36224	373 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	UBP13	P38187	747 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SSN3	P39073	555 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	BOP3	P53958	396 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TCO89	Q08921	799 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	CSR2	Q12734	1121 aa		7.08	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	GSC2	P40989	1895 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.07	□□□□□ -1.28	not detected
MIA40	YKL195W	FBP1	P09201	348 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	PCK1	P10963	549 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	CKI1	P20485	582 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	PER1	P25625	357 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	OCT1	P35999	772 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TGL4	P36165	910 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	BUD16	P39988	312 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SLX8	P40072	274 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	COS5	P47187	383 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SOV1	Q04748	898 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	PHM6	Q05637	104 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	YDL057W	Q07379	328 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	YLR001C	Q07895	862 aa		7.07	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.06	□□□□□ -1.28	not detected
MIA40	YKL195W	RPO26	P20435	155 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SUV3	P32580	737 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	KTR2	P33550	425 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	ATG19	P35193	415 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	UBP11	P36026	717 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	YKR018C	P36114	725 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TBS1	P38114	1094 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SMF1	P38925	575 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	UBP5	P39944	805 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	CUZ1	P53899	274 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SPH1	Q06160	661 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	ATG23	Q06671	453 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	CRD1	Q07560	283 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	DAS2	Q12084	232 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		7.06	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	PHO8	P11491	566 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TUP1	P16649	713 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	TGL1	P34163	548 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	CIN4	P39110	191 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	VAB2	P40003	282 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	FIS1	P40515	155 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	MMM1	P41800	426 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	SGM1	P47166	707 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	UBP15	P50101	1230 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	NGL3	Q03210	505 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	YLR297W	Q05899	129 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	GUD1	Q07729	489 aa		7.05	□□□□□ -1.28
MIA40	YKL195W	MLH2	Q07980	695 aa		7.05	□□□□□ -1.28

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