RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	MCD4	P36051	919 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YHL049C	P38722	271 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SPC72	P39723	622 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YEL075C	P39972	122 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YER189W	P40104	122 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	HOS4	P40480	1083 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YFL064C	P43540	174 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YJR142W	P47173	342 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TDA9	Q04545	1251 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	DPL1	Q05567	589 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	MRX10	Q05648	414 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YLR297W	Q05899	129 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TFB4	Q12004	338 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	GSY1	P23337	708 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PLC1	P32383	869 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PPS1	P38148	807 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	NMD5	P46970	1048 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	VPS53	P47061	822 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	RIM21	P48565	533 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	GUP1	P53154	560 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	RIM8	P53179	542 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SHR3	Q02774	210 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	MFM1	Q02783	413 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YPL109C	Q02981	657 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SAS4	Q04003	481 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SKG3	Q06315	1026 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	IRC3	Q06683	689 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	GNT1	Q12096	491 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SRM1	P21827	482 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SLY41	P22215	453 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PRE8	P23639	250 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	CLB4	P24871	460 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TFC4	P33339	1025 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SLI15	P38283	698 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	FZO1	P38297	855 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SPO19	Q03029	223 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	HOT1	Q03213	719 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SHE9	Q04172	456 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YLH47	Q06493	454 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	ALR1	Q08269	859 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PCK1	P10963	549 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	POL3	P15436	1097 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	IME1	P21190	360 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YME2	P32843	850 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YBR062C	P38239	180 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	REV7	P38927	245 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	ARH1	P48360	493 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	LSB1	P53281	241 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PUS6	P53294	404 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PNP1	Q05788	311 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
SSZ1	YHR064C	MDM38	Q08179	573 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SWI6	P09959	803 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SPO16	P17122	198 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	VAN1	P23642	535 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TRK2	P28584	889 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	STE13	P33894	931 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	SET3	P36124	751 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	VPS45	P38932	577 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	GAA1	P39012	614 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	AXL1	P40851	1208 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	VPS4	P52917	437 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	NSG2	P53898	299 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	CUR1	Q06469	252 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	PCL8	Q08966	492 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	YPL277C	Q08989	487 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	FLO1	P32768	1537 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SSZ1	YHR064C	ACE2	P21192	770 aa		5.65	□□□□□ -1.51
SSZ1	YHR064C	BAS1	P22035	811 aa		5.65	□□□□□ -1.51

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