RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeastyeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR4YLR449W YMR321CQ04898 105 aa14.05□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W LTV1P34078 463 aa14.04□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W BYE1P36106 594 aa14.04□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W SET5P38890 526 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W MMM1P41800 426 aa14.04□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W VPS53P47061 822 aa14.04□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W CST9Q06032 482 aa14.04□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W DUS4Q06063 367 aa14.04□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W DED1P06634 604 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W CDC48P25694 835 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W KIP1P28742 1111 aa14.03□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W SHE10P53075 577 aa14.03□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W SVF1Q05515 481 aa14.03□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W SIL1Q08199 421 aa14.03□□□□□ -0.16
FPR4YLR449W TRP2P00899 507 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RAD54P32863 898 aa14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W TIM23P32897 222 aa14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W ERC1P38767 581 aa14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W SPR3P41901 512 aa14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RTT102P53330 157 aa14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W IES4Q08561 116 aa14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W YDL206WQ12424 762 aa14.02□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W SNF1P06782 633 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W EFT1P32324 842 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W MUD1P32605 298 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W JNM1P36224 373 aa14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W APE3P37302 537 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W SMF1P38925 575 aa14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W NPP2P39997 493 aa14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W AVT1P47082 602 aa14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W VTC3Q02725 835 aa14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W TRM11Q12463 433 aa14.01□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W SEC21P32074 935 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W DPH2P32461 534 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RGT1P32862 1170 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W CNS1P33313 385 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W CAB3P36076 571 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W MXR1P40029 184 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W VPS70P47161 811 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data14□□□□□ -0.17not detected
FPR4YLR449W JIP4Q03361 876 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W NCR1Q12200 1170 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W OSH2Q12451 1283 aa14□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W ERG11P10614 530 aa13.99□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RPO26P20435 155 aa13.99□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W ASH1P34233 588 aa13.99□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W MOT2P34909 587 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W CCT4P39078 528 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W YLR001CQ07895 862 aa13.99□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W OSW2Q12202 724 aa13.99□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W YUR1P26725 428 aa13.98□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W TDA3P38758 523 aa13.98□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RSC30P38781 883 aa13.98□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W MAD1P40957 749 aa13.98□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W SGM1P47166 707 aa13.98□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W ECM7Q06200 448 aa13.98□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RMP1Q12530 201 aa13.98□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data13.97□□□□□ -0.17not detected
FPR4YLR449W KIN82P25341 720 aa13.97□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W KIC1P38692 1080 aa13.97□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W EAF5P39995 279 aa13.97□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W KAP114P53067 1004 aa13.97□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W YNL146WP53906 100 aa13.97□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W ATG23Q06671 453 aa13.97□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W BLI1P35727 113 aa13.96□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W GPI13Q07830 1017 aa13.96□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W GIS3Q12418 502 aa13.96□□□□□ -0.17
FPR4YLR449W NAT1P12945 854 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W SCJ1P25303 377 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W IRE1P32361 1115 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W GCG1P32656 232 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W BCH2P36122 765 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W RCK2P38623 610 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W ETP1P38748 585 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W CUL3P53202 744 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W YML020WQ03722 664 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W YMR018WQ04364 514 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W NUR1Q12066 484 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W SLX4Q12098 748 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W YLL058WQ12198 575 aa13.95□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W PAP1P29468 568 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W NFU1P32860 256 aa13.94□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W JJJ3P47138 172 aa13.94□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W HSH155P49955 971 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W VTI1Q04338 217 aa13.94□□□□□ -0.18
FPR4YLR449W HFI1Q12060 488 aa13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 88.9 ms