RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W SNU71P53207 620 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W RSC58Q07979 502 aa2.86□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W YDL177CQ12257 170 aa2.86□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W PTC5Q12511 572 aa2.86□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W KRE2P27809 442 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W KIP1P28742 1111 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W SEC8P32855 1065 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W APL2P36000 726 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W CCZ1P38273 704 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W RGD1P38339 666 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W PSF2P40359 213 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W FYV10P40492 516 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W MTC3P53077 123 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W TNA1P53322 534 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W YNR063WP53749 607 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W SNF5P18480 905 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W NMD3P38861 518 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W PIK1P39104 1066 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W ROD1Q02805 837 aa2.85□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W MCM2P29469 868 aa2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W FLR1P38124 548 aa2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W SPL2P38839 148 aa2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W GSM1P42950 618 aa2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W CNN1P43618 361 aa2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W FOL2P51601 243 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W VPS62P53285 467 aa2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W FLO1P32768 1537 aa2.84□□□□□ -1.95
SSQ1YLR369W DBP5P20449 482 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W SYP1P25623 870 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RIM8P53179 542 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W SNO2P53823 222 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W MRPL22P53881 309 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W SPR28Q04921 423 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W ECM30Q06673 1274 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W MRL1Q06815 381 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RTT10Q08924 1013 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W SPO21Q12411 609 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W TAD3Q9URQ3 322 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W SOD2P00447 233 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W DED1P06634 604 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W GCR1P07261 785 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W SPS1P08458 490 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W AIM26P32858 118 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W MPH1P40562 993 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W HNT2P49775 206 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W PPM2Q08282 695 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W TOR1P35169 2470 aa2.83□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W YHR131CP38835 850 aa2.82□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W GPB2P39717 880 aa2.82□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W SEC26P41810 973 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RPT4P53549 437 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data2.81□□□□□ -1.96not detected
SSQ1YLR369W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data2.81□□□□□ -1.96 RIP-Chip
SSQ1YLR369W SCT1P32784 759 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W ERG7P38604 731 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W ZDS2P54786 942 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data2.81□□□□□ -1.96not detected
SSQ1YLR369W YDR132CQ03900 495 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W UBX2Q04228 584 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W AHC1Q12433 566 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W NUM1Q00402 2748 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W HIP1P06775 603 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W DUT1P33317 147 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W MNR2P35724 969 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W FCP1Q03254 732 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W GNT1Q12096 491 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W GIN4Q12263 1142 aa2.81□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W YER152CP10356 443 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W CDC34P14682 295 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RAD27P26793 382 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W PEP7P32609 515 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RER2P35196 286 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W PAP2P53632 584 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W VPS64Q03944 604 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W LCB1P25045 558 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W MLS1P30952 554 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W AFG3P39925 761 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W YFL040WP43562 540 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W SIZ1Q04195 904 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RSB1Q08417 382 aa2.8□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W FAB1P34756 2278 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W RPS13P05756 151 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W MGM1P32266 881 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W LYP1P32487 611 aa2.79□□□□□ -1.96
SSQ1YLR369W PET112P33893 541 aa2.79□□□□□ -1.96
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