RNA–Protein interactions for RNA: YLR297W

YLR297W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YLR297W, Length 390 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR297W	YLR297W	SPP41	P38904	1435 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	NTE1	Q04958	1679 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	STE5	P32917	917 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	TRM2	P33753	639 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	ERT1	P38140	529 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	SUN4	P53616	420 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	NTO1	Q12311	748 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	PDR10	P51533	1564 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	TSC11	P40061	1430 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	DNF1	P32660	1571 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	HSF1	P10961	833 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	STE11	P23561	717 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	NPP1	P25353	742 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	YRO2	P38079	344 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	YBR184W	P38299	523 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	SHE9	Q04172	456 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	PNS1	Q12412	539 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	SNT2	P53127	1403 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	YER158C	P40095	573 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.28	□□□□□ -1.72	not detected
YLR297W	YLR297W	MSE1	P48525	536 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YLR297W	YLR297W	VPS15	P22219	1454 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	YBR284W	P38150	797 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	CHA4	P43634	648 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	PUS9	Q12069	462 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	NPC2	Q12408	173 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	ADE8	P04161	214 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	MRP8	P35719	219 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	GYP7	P48365	746 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	KIN4	Q01919	800 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	DCG1	P32460	244 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	RPD3	P32561	433 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	AFR1	P33304	620 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	PBY1	P38254	753 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	MSS4	P38994	779 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	IRR1	P40541	1150 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	AIM21	P40563	679 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	ALR2	P43553	858 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	SLI1	P53304	468 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	UBX5	Q06682	500 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	EXG2	P52911	562 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	NCS6	P53088	359 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	PAN1	P32521	1480 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	KAR4	P25583	335 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	LAS17	Q12446	633 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	BUD3	P25558	1636 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	SPO14	P36126	1683 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	SED4	P25365	1065 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	CEP3	P40969	608 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	PFD1	P46988	109 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	AIM39	Q08223	395 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YLR297W	YLR297W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	TOK1	P40310	691 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	TPO2	P53283	614 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	EAF1	Q06337	982 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	FMP25	Q08023	583 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	UPC2	Q12151	913 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	STE13	P33894	931 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	ATG19	P35193	415 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	IOC3	P43596	787 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	RAD4	P14736	754 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	ARE1	P25628	610 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	LCD1	Q04377	747 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YLR297W	YLR297W	GCN2	P15442	1659 aa		4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.4 ms