RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	CEP3	P40969	608 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	CDC11	P32458	415 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	ERP6	P53198	216 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	AIM39	Q08223	395 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	ENB1	Q08299	606 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	FBP1	P09201	348 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	PET10	P36139	283 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	CHS7	P38843	316 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	TIM54	P47045	478 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	BUL1	P48524	976 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	HDA1	P53973	706 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	OSH2	Q12451	1283 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	HSL1	P34244	1518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	DNA2	P38859	1522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
PEX18	YHR160C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	VPS30	Q02948	557 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	GUP2	Q08929	609 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	SDP1	P40479	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	ENV7	Q12003	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	KOG1	P38873	1557 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	CIT1	P00890	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	CTF4	Q01454	927 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX18	YHR160C	HUL5	P53119	910 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	TAF8	Q03750	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	PEX19	Q07418	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	FLC1	Q08967	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	TRM13	Q12383	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	CTF8	P38877	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	ERG5	P54781	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	BET3	P36149	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	SUL1	P38359	859 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	ERG4	P25340	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	HUL4	P40985	892 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	GYP8	P43570	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	DAL7	P21826	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	YHR078W	P38799	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	RTA1	P53047	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	PUS2	P53167	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	SWM1	Q12379	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	YCL002C	P25565	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	CTF13	P35203	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	YJL049W	P47048	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
PEX18	YHR160C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	BDF2	Q07442	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX18	YHR160C	CAN1	P04817	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	RAD53	P22216	821 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	KTR4	P38131	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	MOH1	P38191	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	VHR1	P40522	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	NIT3	P49954	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	TAD1	P53065	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	MRPS35	P53292	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	EMC3	P36039	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	PPM2	Q08282	695 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	TRM11	Q12463	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	HIR3	P47171	1648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	RPP1	P38786	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	RNT1	Q02555	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	NSE3	Q05541	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	PRC1	P00729	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
PEX18	YHR160C	ALG7	P07286	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	SCT1	P32784	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	OAR1	P35731	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	FKH2	P41813	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	ALG2	P43636	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	ASI2	P53895	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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