RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	IMP2'	P32351	346 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	YME2	P32843	850 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	MRP4	P32902	394 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	CSE1	P33307	960 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	STE13	P33894	931 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	YHL050C	P38721	697 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	MDE1	P47095	244 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	RET3	P53600	189 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	RPM2	Q02773	1202 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	UBX2	Q04228	584 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	GYP1	Q08484	637 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	TMA17	Q12513	150 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	BNR1	P40450	1375 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	ARG81	P05085	880 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	SSO1	P32867	290 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	STV1	P37296	890 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	CIN4	P39110	191 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	NIT1	P40447	199 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	APS3	P47064	194 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	YNL193W	P53870	558 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	PET112	P33893	541 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	HCS1	P34243	683 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	ATG3	P40344	310 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	PKP1	P40530	394 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	URB2	P47108	1174 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	SSN8	P47821	323 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	YML6	P51998	286 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	TRM8	Q12009	286 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	FRT1	Q99332	602 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSC7	YHR039C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	DUR3	P33413	735 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	VPS35	P34110	944 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	PTH2	P34222	208 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	ALG14	P38242	237 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	YAP3	P38749	330 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	MBP1	P39678	833 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	YJR061W	P40355	935 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	YJR120W	P47157	116 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	ENT3	P47160	408 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	YGR266W	P53326	701 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	YML131W	Q03102	365 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	VPS16	Q03308	798 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	TRS130	Q03660	1102 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	YDR131C	Q03899	556 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	KRE28	Q04431	385 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.6	not detected
MSC7	YHR039C	PIN2	Q12057	282 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	BUG1	Q12191	341 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	MNL2	Q12205	849 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	MED4	Q12343	284 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	OM45	P16547	393 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	SPO16	P17122	198 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	RPC53	P25441	422 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	CHS3	P29465	1165 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	UBP11	P36026	717 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	CCZ1	P38273	704 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	IPI3	P53877	555 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	LCD1	Q04377	747 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	SDH5	Q08230	162 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	BUD7	Q08754	746 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	ACF2	Q12168	779 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	DNF3	Q12674	1656 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	PHO8	P11491	566 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	VPH2	P32341	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	MET4	P32389	672 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	LYP1	P32487	611 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MSC7	YHR039C	PEP7	P32609	515 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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