RNA–Protein interactions for RNA: YHR014W

SPO13, Transcript of Meiotic regulator, yeast

Gene SPO13, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO13	YHR014W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	BUL1	P48524	976 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	LCD1	Q04377	747 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	SWM1	Q12379	170 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	YBR184W	P38299	523 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	SDP1	P40479	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	PFD1	P46988	109 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	DAS1	P47005	663 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
SPO13	YHR014W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	TRM11	Q12463	433 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	FBP1	P09201	348 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	ALG7	P07286	448 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	NPP1	P25353	742 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	NGG1	P32494	702 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	REC104	P33323	182 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	CTF8	P38877	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	DLT1	Q04216	342 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SPO13	YHR014W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	AFR1	P33304	620 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	CTF13	P35203	478 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	STB4	P50104	949 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	PUS2	P53167	370 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
SPO13	YHR014W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	TMN2	Q04562	672 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	FMP25	Q08023	583 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	RAD4	P14736	754 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	CEP3	P40969	608 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	SPO75	Q07798	868 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	IRC10	Q08118	586 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	ERT1	P38140	529 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	YHR078W	P38799	552 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	ELO3	P40319	345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	NIT3	P49954	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	YHL017W	P38745	532 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	TOK1	P40310	691 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	ALR2	P43553	858 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	ERP6	P53198	216 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	ERG5	P54781	538 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	UBX5	Q06682	500 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	FRE5	Q08908	694 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	RPD3	P32561	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	AMA1	P50082	593 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	PKH1	Q03407	766 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	RPP1	P38786	293 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	ATF1	P40353	525 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	TIM54	P47045	478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	HDA1	P53973	706 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	EAF1	Q06337	982 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	MTH1	P35198	433 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	SPC42	P36094	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	YBR284W	P38150	797 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	PZF1	P39933	429 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	YJL049W	P47048	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	HUL5	P53119	910 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	ADY4	Q05955	493 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	BDF2	Q07442	638 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SPO13	YHR014W	TOP3	P13099	656 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	ARE1	P25628	610 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	PET10	P36139	283 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	SDS3	P40505	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	GND2	P53319	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	CRR1	Q05790	422 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	CIT1	P00890	479 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	CDC43	P18898	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	OCA5	P38738	679 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	VHR1	P40522	640 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	FKH2	P41813	862 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	NNF1	P47149	201 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	RIA1	P53893	1110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	ASI2	P53895	289 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SPO13	YHR014W	MUK1	Q02866	612 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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