RNA–Protein interactions for RNA: YGR274C

TAF1, Transcript of TFIID subunit, involved in RNA pol II transcription initiation, yeast

Gene TAF1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAF1	YGR274C	NCA2	Q12374	616 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SNF3	P10870	884 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	MRPS28	P21771	286 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	BAS1	P22035	811 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YCR051W	P25631	222 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YME1	P32795	747 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SUL1	P38359	859 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	UBP9	P39967	754 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	ATP25	Q03153	612 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	GNT1	Q12096	491 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	MED1	Q12321	566 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	CKA2	P19454	339 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	REC107	P21651	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SPC72	P39723	622 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	UBP5	P39944	805 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	TDA10	P42938	290 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	VPS53	P47061	822 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	NNF2	P53253	936 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YLR177W	Q06251	628 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YDL057W	Q07379	328 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	PSF3	Q12146	194 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	ADH4	P10127	382 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	MRPL25	P23369	157 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	PRE8	P23639	250 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	PUP2	P32379	260 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	CDC11	P32458	415 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	TFC4	P33339	1025 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	EXO5	P38289	585 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	ERP5	P38819	212 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	DIP5	P53388	608 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	EEB1	Q02891	456 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RKM4	Q12504	494 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SRM1	P21827	482 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	MRE11	P32829	692 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	CCL1	P37366	393 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	VHC1	P38329	1120 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	STN1	P38960	494 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	GAA1	P39012	614 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	PES4	P39684	611 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	HXT8	P40886	569 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	TAF1	P46677	1066 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	COS5	P47187	383 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	HOP2	P53187	214 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	VPS16	Q03308	798 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	DPL1	Q05567	589 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YPR097W	Q06839	1073 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	CLN3	P13365	580 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	HEM3	P28789	327 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	PLC1	P32383	869 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	TOA1	P32773	286 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YEL1	P34225	687 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	MSG5	P38590	489 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RCK2	P38623	610 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	LAM1	P38851	1228 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YIL001W	P40560	513 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	RIP-Chip
TAF1	YGR274C	MFM1	Q02783	413 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YMR187C	Q03236	431 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SHE9	Q04172	456 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	HFD1	Q04458	532 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	MGT1	P26188	188 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	DBF4	P32325	704 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	VPS35	P34110	944 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	TFC3	P34111	1160 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	RRN3	P36070	627 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	SET4	P42948	560 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YKU80	Q04437	629 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TAF1	YGR274C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms