RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W GPI13Q07830 1017 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SMC5Q08204 1093 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W APL1P27351 700 aa9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W NAM7P30771 971 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W RME1P32338 300 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W COT1P32798 439 aa9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W FIG4P42837 879 aa9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W FYV8P46949 817 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W MDR1P53258 950 aa9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W BNI4P53858 892 aa9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W CTR9P89105 1077 aa9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SVF1Q05515 481 aa9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W HMI1Q12039 706 aa9.7□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SSB1P11484 613 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W EFT1P32324 842 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W IRE1P32361 1115 aa9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W BCS1P32839 456 aa9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W XDJ1P39102 459 aa9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SSB2P40150 613 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W IES4Q08561 116 aa9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W ICL2Q12031 575 aa9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W YLL058WQ12198 575 aa9.69□□□□□ -0.86
DDI1YER143W MOT1P32333 1867 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W TUP1P16649 713 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SPC110P32380 944 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W ATG19P35193 415 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W PCH2P38126 564 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W CCC2P38995 1004 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W RTT102P53330 157 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W NMA111P53920 997 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W ERG5P54781 538 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W ATG9Q12142 997 aa9.68□□□□□ -0.86
DDI1YER143W MAS2P11914 482 aa9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W STU2P46675 888 aa9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W TAD1P53065 400 aa9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W ENV11P53246 860 aa9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W UME1Q03010 460 aa9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W DON1Q05610 365 aa9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W YLR287CQ05881 355 aa9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
DDI1YER143W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SPO12P17123 173 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W MFT1P33441 392 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W KTR2P33550 425 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W EAF5P39995 279 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W ATG3P40344 310 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W PSP2P50109 593 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W NCS6P53088 359 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W BRE5P53741 515 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W YNL146WP53906 100 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W TIM8P57744 87 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W VTC3Q02725 835 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W YCG1Q06680 1035 aa9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
DDI1YER143W RIF1P29539 1916 aa9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W UBC1P21734 215 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SMY2P32909 740 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W VPS35P34110 944 aa9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W AFG3P39925 761 aa9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SDS3P40505 327 aa9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SAD1P43589 448 aa9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W ALF1P53904 254 aa9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W YLR297WQ05899 129 aa9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W MLH2Q07980 695 aa9.65□□□□□ -0.86
DDI1YER143W CHS2P14180 963 aa9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data9.64□□□□□ -0.87not detected
DDI1YER143W SKP2P42843 763 aa9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W IES1P43579 692 aa9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W VPS38Q05919 439 aa9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W PLP2Q12017 286 aa9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SUT2Q12286 268 aa9.64□□□□□ -0.87
DDI1YER143W SEC23P15303 768 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W PDC6P26263 563 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W DPH2P32461 534 aa9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W MUD1P32605 298 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W TMT1P32643 299 aa9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YKL023WP36103 277 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W GUA1P38625 525 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W PSF2P40359 213 aa9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ORC5P50874 479 aa9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W MSC2Q03455 724 aa9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W YML020WQ03722 664 aa9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ATG11Q12527 1178 aa9.63□□□□□ -0.87
DDI1YER143W RAD54P32863 898 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W XRS2P33301 854 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W GPT2P36148 743 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W NPP2P39997 493 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W AIM21P40563 679 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W OSW7P43611 510 aa9.62□□□□□ -0.87
DDI1YER143W ACF4P47129 309 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.1 ms