RNA–Protein interactions for RNA: YDL208W

NHP2, Transcript of Protein related to mammalian high mobility group (HMG) proteins, yeastyeast

Gene NHP2, Length 471 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NHP2YDL208W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W SUT2Q12286 268 aa3.55□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W SWM1Q12379 170 aa3.55□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W TUB3P09734 445 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.54□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W HCA4P20448 770 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W TDP1P38319 544 aa3.53□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W VPS16Q03308 798 aa3.53□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W AFT2Q08957 416 aa3.53□□□□□ -1.84
NHP2YDL208W BNR1P40450 1375 aa3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W ADE8P04161 214 aa3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W CDC43P18898 376 aa3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W PEX2P32800 271 aa3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W PPZ2P33329 710 aa3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W TAH11P47112 604 aa3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W FAA4P47912 694 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W SHE9Q04172 456 aa3.52□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W NPP1P25353 742 aa3.51□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W RPP1P38786 293 aa3.51□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W SIT1P39980 628 aa3.51□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W AMA1P50082 593 aa3.51□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W MUP1P50276 574 aa3.51□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W RIA1P53893 1110 aa3.51□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W ICT1Q12385 394 aa3.51□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W PPH3P32345 308 aa3.5□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W AFR1P33304 620 aa3.5□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W YIL166CP40445 542 aa3.5□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W GDE1Q02979 1223 aa3.5□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W YDR306CQ06640 478 aa3.5□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W RPD3P32561 433 aa3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W SCT1P32784 759 aa3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W VBA5P36172 582 aa3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W YBR053CP38235 358 aa3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W FKH2P41813 862 aa3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W YJL163CP46996 555 aa3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W YKR011CQ02209 353 aa3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W ARO10Q06408 635 aa3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W MDM10P18409 493 aa3.48□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W RFA1P22336 621 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W YHR078WP38799 552 aa3.48□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W HDA1P53973 706 aa3.48□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W MET6P05694 767 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W CLN2P20438 545 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W KIN3P22209 435 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W FLO10P36170 1169 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W PCL5P38794 229 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W TPO2P53283 614 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W MRPS35P53292 345 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W ASI2P53895 289 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W CRR1Q05790 422 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W YAP7Q08182 245 aa3.47□□□□□ -1.85
NHP2YDL208W PRP4P20053 465 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W NAP1P25293 417 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W DMC1P25453 334 aa3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W NGG1P32494 702 aa3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W TMT1P32643 299 aa3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W YRO2P38079 344 aa3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W SGO1Q08490 590 aa3.46□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W ADY2P25613 283 aa3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W URA1P28272 314 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W MRP8P35719 219 aa3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W PBY1P38254 753 aa3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W VHR1P40522 640 aa3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W YIR042CP40586 236 aa3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W CEP3P40969 608 aa3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W PKH1Q03407 766 aa3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W LCD1Q04377 747 aa3.45□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.44□□□□□ -1.86not detected
NHP2YDL208W DAM1P53267 343 aa3.44□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W SSL2Q00578 843 aa3.44□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W OPI10Q08202 246 aa3.44□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W REC104P33323 182 aa3.43□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W GLO1P50107 326 aa3.43□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W SEC5P89102 971 aa3.43□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W YML020WQ03722 664 aa3.43□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W THI7Q05998 598 aa3.43□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W FMP52P40008 231 aa3.42□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W TOK1P40310 691 aa3.42□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W NRG1Q03125 231 aa3.42□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W IRC13Q08630 104 aa3.42□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W PIN2Q12057 282 aa3.42□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W MPH2P0CD99 609 aa3.41□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W GGA2P38817 585 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W PZF1P39933 429 aa3.41□□□□□ -1.86
NHP2YDL208W IRR1P40541 1150 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms