RNA–Protein interactions for RNA: Q0105

COB, Transcript of Cytochrome b, yeast

Gene COB, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COB	Q0105	ERG5	P54781	538 aa		5	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	ALG7	P07286	448 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	PRI2	P20457	528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	VAC8	P39968	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	TRM11	Q12463	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	MET3	P08536	511 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	CTF8	P38877	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	IRC10	Q08118	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	SWM1	Q12379	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	CTF13	P35203	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	ATF1	P40353	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	YMR206W	Q03695	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	LCD1	Q04377	747 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	AIM44	Q99299	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COB	Q0105	DAS1	P47005	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	YKR011C	Q02209	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	DLT1	Q04216	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	RPD3	P32561	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	FRE5	Q08908	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	TRM13	Q12383	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	CDC11	P32458	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	REC104	P33323	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	TOK1	P40310	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	ELO3	P40319	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	CEP3	P40969	608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
COB	Q0105	MUK1	Q02866	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	MTH1	P35198	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	STE5	P32917	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	YHL017W	P38745	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	YHR078W	P38799	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	PUS2	P53167	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	GND2	P53319	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	HDA1	P53973	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	SPC42	P36094	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	RPP1	P38786	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	SDS3	P40505	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COB	Q0105	MPH2	P0CD99	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	ERT1	P38140	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	PFD1	P46988	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	ADY4	Q05955	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	PPS1	P38148	807 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	YBR184W	P38299	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	BDF2	Q07442	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	NGG1	P32494	702 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	FKH2	P41813	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	ALR2	P43553	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	ASI2	P53895	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	PKH1	Q03407	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	FMP25	Q08023	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	PET10	P36139	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	AMA1	P50082	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	MUP1	P50276	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	YPR071W	Q12346	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	VHR1	P40522	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	NIT3	P49954	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	ERP6	P53198	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	SPO75	Q07798	868 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	ENV7	Q12003	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	YBR284W	P38150	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	PZF1	P39933	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	CRR1	Q05790	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	YBR053C	P38235	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	MRPS35	P53292	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	RIA1	P53893	1110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	EAF1	Q06337	982 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	HAL9	Q12180	1030 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
COB	Q0105	NDJ1	Q12366	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COB	Q0105	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
COB	Q0105	YJL163C	P46996	555 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COB	Q0105	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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