RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gja10Q9WUS4 505 aa28.59■■■□□ 2.17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ank1Q02357 1862 aa28.59■■■□□ 2.17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm7347D3YYI9 267 aa28.58■■■□□ 2.17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Speer4aF8VPX6 267 aa28.58■■■□□ 2.17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Aplp1Q03157 653 aa28.57■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp7a1Q64505 503 aa28.57■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ehd4Q9EQP2 541 aa28.57■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 UvssaQ9D479 717 aa28.56■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znf609Q8BZ47 1413 aa28.55■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CanxP35564 591 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Vil1Q62468 827 aa28.55■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Insm1Q63ZV0 521 aa28.55■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Igflr1Q3U4N7 345 aa28.54■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28.54■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trim26Q99PN3 545 aa28.54■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam213aQ9CYH2 218 aa28.54■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Myh1Q5SX40 1942 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Golgb1E9PVZ8 3238 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nup188Q6ZQH8 1759 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Csf1rP09581 977 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Clca2Q8BG22 942 aa28.53■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa28.52■■■□□ 2.16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Exoc6bA6H5Z3 810 aa28.51■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc60Q8C4J0 545 aa28.51■■■□□ 2.15
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Col24a1Q30D77 1733 aa28.51■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Usp48Q3V0C5 1052 aa28.5■■■□□ 2.15
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ttc19Q8CC21 365 aa28.49■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa28.48■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 EappQ5BU09 281 aa28.48■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 HellsQ60848 821 aa28.48■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dydc2Q9D3X8 139 aa28.48■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Setdb1O88974 1307 aa28.47■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Vsig10D3YX43 558 aa28.47■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ripor2Q80U16 1078 aa28.47■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Adarb2Q9JI20 745 aa28.47■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Myo3bQ1EG27 1305 aa28.46■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trim34bJ3QNR8 485 aa28.46■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zbtb38Q3LR78 1197 aa28.46■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znf428Q8C1M2 176 aa28.46■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Btaf1E9QAE3 1848 aa28.46■■■□□ 2.15
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Oas2E9Q9A9 742 aa28.45■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NmiO35309 314 aa28.45■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 BcanQ61361 883 aa28.44■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gpr101Q80T62 511 aa28.44■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PgfP49764 158 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lrch1P62046 709 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa28.43■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Polr3glQ8R0C0 218 aa28.42■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rps8P62242 208 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Greb1lB9EJV3 1913 aa28.41■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Scn9aQ62205 1984 aa28.41■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kif2cQ922S8 721 aa28.4■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Myoz2Q9JJW5 264 aa28.4■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Chrna5Q2MKA5 467 aa28.39■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tmco5bQ80X59 307 aa28.39■■■□□ 2.14
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zfp646Q6NV66 1788 aa28.39■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Bend3Q6PAL0 825 aa28.38■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Best3Q6H1V1 669 aa28.37■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Naa16Q9DBB4 864 aa28.37■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Map3k15A2AQW0 1331 aa28.37■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Glt1d1A4FUP9 346 aa28.36■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nectin2P32507 530 aa28.36■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NfixP70257 488 aa28.36■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rbm46P86049 533 aa28.36■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa28.36■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zap70P43404 618 aa28.35■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Aifm3Q3TY86 605 aa28.35■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Eif6O55135 245 aa28.34■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Smc4Q8CG47 1286 aa28.34■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ltn1Q6A009 1767 aa28.33■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gja3Q64448 417 aa28.33■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lgr5Q9Z1P4 907 aa28.33■■■□□ 2.13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PnnO35691 725 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Map3k13Q1HKZ5 959 aa28.32■■■□□ 2.12
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Glis2Q8VDL9 521 aa28.32■■■□□ 2.12
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Eddm13E9Q7F5 164 aa28.31■■■□□ 2.12
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Map9Q3TRR0 646 aa28.31■■■□□ 2.12
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Psmd1Q3TXS7 953 aa28.31■■■□□ 2.12
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