Protein–RNA interactions for Protein: P43404

Zap70, Tyrosine-protein kinase ZAP-70, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zap70P43404 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.73■■■■■ 5.23
Zap70P43404 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Zap70P43404 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Zap70P43404 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Zap70P43404 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Zap70P43404 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Zap70P43404 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Zap70P43404 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Zap70P43404 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Zap70P43404 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Zap70P43404 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Zap70P43404 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Zap70P43404 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Zap70P43404 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Zap70P43404 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Zap70P43404 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Zap70P43404 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Zap70P43404 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Zap70P43404 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Zap70P43404 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Zap70P43404 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Zap70P43404 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Zap70P43404 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Zap70P43404 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Zap70P43404 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Zap70P43404 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Zap70P43404 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Zap70P43404 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Zap70P43404 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Zap70P43404 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Zap70P43404 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Zap70P43404 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Zap70P43404 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Zap70P43404 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Zap70P43404 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Zap70P43404 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Zap70P43404 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Zap70P43404 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Zap70P43404 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Zap70P43404 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Zap70P43404 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Zap70P43404 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Zap70P43404 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Zap70P43404 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Zap70P43404 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Zap70P43404 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Zap70P43404 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Zap70P43404 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Zap70P43404 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Zap70P43404 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Zap70P43404 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Zap70P43404 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Zap70P43404 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Zap70P43404 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Zap70P43404 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Zap70P43404 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Zap70P43404 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Zap70P43404 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Zap70P43404 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Zap70P43404 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Zap70P43404 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Zap70P43404 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Zap70P43404 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Zap70P43404 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Zap70P43404 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Zap70P43404 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Zap70P43404 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Zap70P43404 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Zap70P43404 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Zap70P43404 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Zap70P43404 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Zap70P43404 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Zap70P43404 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Zap70P43404 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Zap70P43404 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Zap70P43404 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Zap70P43404 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Zap70P43404 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Zap70P43404 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Zap70P43404 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Zap70P43404 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Zap70P43404 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Zap70P43404 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Zap70P43404 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Zap70P43404 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Zap70P43404 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Zap70P43404 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Zap70P43404 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Zap70P43404 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Zap70P43404 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Zap70P43404 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Zap70P43404 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Zap70P43404 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Zap70P43404 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Zap70P43404 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Zap70P43404 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Zap70P43404 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Zap70P43404 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Zap70P43404 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Zap70P43404 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms