Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,81■■■■■ 5,24
Best3Q6H1V1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,31■■■■■ 4,68
Best3Q6H1V1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,66■■■■■ 4,58
Best3Q6H1V1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41,58■■■■■ 4,25
Best3Q6H1V1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,55■■■■■ 4,24
Best3Q6H1V1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,65■■■■■ 4,1
Best3Q6H1V1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Best3Q6H1V1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Best3Q6H1V1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Best3Q6H1V1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,89■■■■□ 3,98
Best3Q6H1V1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Best3Q6H1V1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Best3Q6H1V1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Best3Q6H1V1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Best3Q6H1V1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,8■■■■□ 3,8
Best3Q6H1V1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,5■■■■□ 3,75
Best3Q6H1V1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,45■■■■□ 3,75
Best3Q6H1V1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,44■■■■□ 3,74
Best3Q6H1V1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,39■■■■□ 3,74
Best3Q6H1V1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Best3Q6H1V1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Best3Q6H1V1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Best3Q6H1V1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Best3Q6H1V1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Best3Q6H1V1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,88■■■■□ 3,65
Best3Q6H1V1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Best3Q6H1V1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,83■■■■□ 3,65
Best3Q6H1V1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Best3Q6H1V1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,82■■■■□ 3,64
Best3Q6H1V1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Best3Q6H1V1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Best3Q6H1V1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Best3Q6H1V1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,24■■■■□ 3,55
Best3Q6H1V1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Best3Q6H1V1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Best3Q6H1V1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Best3Q6H1V1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Best3Q6H1V1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Best3Q6H1V1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Best3Q6H1V1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Best3Q6H1V1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,66■■■■□ 3,46
Best3Q6H1V1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Best3Q6H1V1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Best3Q6H1V1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Best3Q6H1V1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,32■■■■□ 3,41
Best3Q6H1V1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Best3Q6H1V1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,31■■■■□ 3,4
Best3Q6H1V1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Best3Q6H1V1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Best3Q6H1V1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Best3Q6H1V1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,89■■■■□ 3,34
Best3Q6H1V1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,85■■■■□ 3,33
Best3Q6H1V1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Best3Q6H1V1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Best3Q6H1V1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Best3Q6H1V1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Best3Q6H1V1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Best3Q6H1V1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Best3Q6H1V1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Best3Q6H1V1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Best3Q6H1V1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,51■■■■□ 3,28
Best3Q6H1V1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Best3Q6H1V1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Best3Q6H1V1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Best3Q6H1V1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Best3Q6H1V1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Best3Q6H1V1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Best3Q6H1V1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Best3Q6H1V1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Best3Q6H1V1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Best3Q6H1V1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Best3Q6H1V1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,27■■■■□ 3,24
Best3Q6H1V1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Best3Q6H1V1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Best3Q6H1V1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Best3Q6H1V1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Best3Q6H1V1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Best3Q6H1V1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Best3Q6H1V1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Best3Q6H1V1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Best3Q6H1V1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Best3Q6H1V1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Best3Q6H1V1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Best3Q6H1V1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Best3Q6H1V1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Best3Q6H1V1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Best3Q6H1V1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Best3Q6H1V1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Best3Q6H1V1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,14
Best3Q6H1V1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
Best3Q6H1V1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Best3Q6H1V1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Best3Q6H1V1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Best3Q6H1V1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Best3Q6H1V1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Best3Q6H1V1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Best3Q6H1V1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Best3Q6H1V1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Best3Q6H1V1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Best3Q6H1V1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms