Protein–RNA interactions for Protein: D3YX43

Vsig10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10D3YX43 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
Vsig10D3YX43 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
Vsig10D3YX43 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Vsig10D3YX43 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
Vsig10D3YX43 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Vsig10D3YX43 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Vsig10D3YX43 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Vsig10D3YX43 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Vsig10D3YX43 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Vsig10D3YX43 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Vsig10D3YX43 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Vsig10D3YX43 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Vsig10D3YX43 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Vsig10D3YX43 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Vsig10D3YX43 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Vsig10D3YX43 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Vsig10D3YX43 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Vsig10D3YX43 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Vsig10D3YX43 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Vsig10D3YX43 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Vsig10D3YX43 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Vsig10D3YX43 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Vsig10D3YX43 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Vsig10D3YX43 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Vsig10D3YX43 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Vsig10D3YX43 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Vsig10D3YX43 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Vsig10D3YX43 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Vsig10D3YX43 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Vsig10D3YX43 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Vsig10D3YX43 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Vsig10D3YX43 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Vsig10D3YX43 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Vsig10D3YX43 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Vsig10D3YX43 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Vsig10D3YX43 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Vsig10D3YX43 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Vsig10D3YX43 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Vsig10D3YX43 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Vsig10D3YX43 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Vsig10D3YX43 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Vsig10D3YX43 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Vsig10D3YX43 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Vsig10D3YX43 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Vsig10D3YX43 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Vsig10D3YX43 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Vsig10D3YX43 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Vsig10D3YX43 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Vsig10D3YX43 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Vsig10D3YX43 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Vsig10D3YX43 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Vsig10D3YX43 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Vsig10D3YX43 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Vsig10D3YX43 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Vsig10D3YX43 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Vsig10D3YX43 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Vsig10D3YX43 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Vsig10D3YX43 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Vsig10D3YX43 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Vsig10D3YX43 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Vsig10D3YX43 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Vsig10D3YX43 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Vsig10D3YX43 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Vsig10D3YX43 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Vsig10D3YX43 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Vsig10D3YX43 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Vsig10D3YX43 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Vsig10D3YX43 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Vsig10D3YX43 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Vsig10D3YX43 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Vsig10D3YX43 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Vsig10D3YX43 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Vsig10D3YX43 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Vsig10D3YX43 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Vsig10D3YX43 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Vsig10D3YX43 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Vsig10D3YX43 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Vsig10D3YX43 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Vsig10D3YX43 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Vsig10D3YX43 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Vsig10D3YX43 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Vsig10D3YX43 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Vsig10D3YX43 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Vsig10D3YX43 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Vsig10D3YX43 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Vsig10D3YX43 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Vsig10D3YX43 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Vsig10D3YX43 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Vsig10D3YX43 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Vsig10D3YX43 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Vsig10D3YX43 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Vsig10D3YX43 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Vsig10D3YX43 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Vsig10D3YX43 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Vsig10D3YX43 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Vsig10D3YX43 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Vsig10D3YX43 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Vsig10D3YX43 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Vsig10D3YX43 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Vsig10D3YX43 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms