RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51,44■■■■■ 5,83
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NischQ80TM9 1593 aa50,69■■■■■ 5,71
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Abcc8B2RUS7 1588 aa49,07■■■■■ 5,45
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Abcc9P70170 1546 aa49,01■■■■■ 5,44
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 ScribQ80U72 1612 aa47,38■■■■■ 5,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NacadQ5SWP3 1504 aa45,98■■■■■ 4,95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kdm5dQ62240 1548 aa45,8■■■■■ 4,92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dcaf1Q80TR8 1506 aa45,16■■■■■ 4,82
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sycp2Q9CUU3 1500 aa45,07■■■■■ 4,81
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 BicraF8VPZ9 1578 aa44,43■■■■■ 4,7
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44,14■■■■■ 4,66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rhox8Q6VSS7 320 aa43,58■■■■■ 4,57
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa43,53■■■■■ 4,56
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Baz1aO88379 1555 aa43,52■■■■■ 4,56
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc180J3QNE4 1664 aa43,52■■■■■ 4,56
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43,52■■■■■ 4,56
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43,35■■■■■ 4,53
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP42,97■■■■■ 4,47
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42,91■■■■■ 4,46
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP42,87■■■■■ 4,45
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ercc6F8VPZ5 1481 aa42,38■■■■■ 4,38
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42,38■■■■■ 4,37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42,33■■■■■ 4,37
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa42,27■■■■■ 4,36
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa42,17■■■■■ 4,34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42,15■■■■■ 4,34
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam135aQ6NS59 1506 aa41,98■■■■■ 4,31
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Wdr62Q3U3T8 1523 aa41,85■■■■■ 4,29
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Frmpd1A2AKB4 1549 aa41,81■■■■■ 4,28
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP41,71■■■■■ 4,27
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Baz1bQ9Z277 1479 aa41,66■■■■■ 4,26
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41,33■■■■■ 4,21
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rtl1Q7M732 1744 aa41,3■■■■■ 4,2
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CftrP26361 1476 aa41,21■■■■■ 4,19
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41,15■■■■■ 4,18
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Unc13aQ4KUS2 1712 aa41,11■■■■■ 4,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP41,1■■■■■ 4,17
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Synj1Q8CHC4 1574 aa41,03■■■■■ 4,16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mrc2Q64449 1479 aa41,02■■■■■ 4,16
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40,83■■■■■ 4,13
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40,52■■■■■ 4,08
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,36■■■■■ 4,05
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trim41Q5NCC3 630 aa40,32■■■■■ 4,05
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cux2P70298 1426 aa40,29■■■■■ 4,04
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kif15Q6P9L6 1387 aa40,26■■■■■ 4,04
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40,07■■■■■ 4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lamc3Q9R0B6 1581 aa40,06■■■■■ 4
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kif21aQ9QXL2 1672 aa39,93■■■■□ 3,98
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP39,92■■■■□ 3,98
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cep164Q5DU05 1446 aa39,74■■■■□ 3,95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dnajc5P60904 198 aa39,73■■■■□ 3,95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP39,54■■■■□ 3,92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc18Q640L5 1455 aa39,53■■■■□ 3,92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Golga3P55937 1487 aa39,52■■■■□ 3,92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 TnnQ80Z71 1560 aa39,51■■■■□ 3,92
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Top2bQ64511 1612 aa39,46■■■■□ 3,91
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39,43■■■■□ 3,9
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Il27Q8K3I6 234 aa39,38■■■■□ 3,89
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP39,36■■■■□ 3,89
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39,35■■■■□ 3,89
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cngb1E1AZ71 1325 aa39,33■■■■□ 3,89
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Plb1Q3TTY0 1478 aa39,3■■■■□ 3,88
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Camsap1A2AHC3 1581 aa39,28■■■■□ 3,88
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Shroom2A2ALU4 1481 aa39,24■■■■□ 3,87
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Crocc2F6XLV1 1638 aa39,2■■■■□ 3,87
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fmn1Q05860 1466 aa39,14■■■■□ 3,86
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP39,07■■■■□ 3,85
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ift140E9PY46 1464 aa39,01■■■■□ 3,84
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Duox2A2AQ99 1517 aa38,89■■■■□ 3,82
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rusc2Q80U22 1514 aa38,85■■■■□ 3,81
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP38,85■■■■□ 3,81
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Grin2bQ01097 1482 aa38,76■■■■□ 3,8
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Col17a1Q07563 1470 aa38,7■■■■□ 3,79
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Disp1Q3TDN0 1521 aa38,66■■■■□ 3,78
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Efcab5A0JP43 1406 aa38,61■■■■□ 3,77
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP38,52■■■■□ 3,76
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa38,52■■■■□ 3,76
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP38,51■■■■□ 3,76
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38,51■■■■□ 3,76
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Samd9lQ69Z37 1561 aa38,49■■■■□ 3,75
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38,34■■■■□ 3,73
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa38,34■■■■□ 3,73
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP38,33■■■■□ 3,73
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 NrkQ9R0G8 1455 aa38,32■■■■□ 3,72
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP38,29■■■■□ 3,72
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38,27■■■■□ 3,72
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Grin2aP35436 1464 aa38,23■■■■□ 3,71
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38,19■■■■□ 3,7
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38,19■■■■□ 3,7
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fgd6Q69ZL1 1399 aa38,13■■■■□ 3,69
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Shroom4Q1W617 1475 aa38,09■■■■□ 3,69
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Chic1Q8CBW7 227 aa38,05■■■■□ 3,68
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PtprkP35822 1457 aa38,01■■■■□ 3,67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gpatch8A2A6A1 1505 aa37,97■■■■□ 3,67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 SynmQ70IV5 1561 aa37,95■■■■□ 3,67
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pla2r1Q62028 1487 aa37,93■■■■□ 3,66
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Adgrl3Q80TS3 1537 aa37,87■■■■□ 3,65
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa37,84■■■■□ 3,65
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cep170Q6A065 1588 aa37,81■■■■□ 3,64
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zeb1Q64318 1117 aa37,8■■■■□ 3,64
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