Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
Bend3Q6PAL0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Bend3Q6PAL0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Bend3Q6PAL0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Bend3Q6PAL0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Bend3Q6PAL0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Bend3Q6PAL0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Bend3Q6PAL0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Bend3Q6PAL0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Bend3Q6PAL0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Bend3Q6PAL0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Bend3Q6PAL0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Bend3Q6PAL0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Bend3Q6PAL0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Bend3Q6PAL0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Bend3Q6PAL0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Bend3Q6PAL0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Bend3Q6PAL0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Bend3Q6PAL0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Bend3Q6PAL0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Bend3Q6PAL0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Bend3Q6PAL0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Bend3Q6PAL0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Bend3Q6PAL0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Bend3Q6PAL0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Bend3Q6PAL0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Bend3Q6PAL0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Bend3Q6PAL0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Bend3Q6PAL0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Bend3Q6PAL0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Bend3Q6PAL0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Bend3Q6PAL0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Bend3Q6PAL0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Bend3Q6PAL0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Bend3Q6PAL0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Bend3Q6PAL0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Bend3Q6PAL0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Bend3Q6PAL0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Bend3Q6PAL0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Bend3Q6PAL0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Bend3Q6PAL0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Bend3Q6PAL0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Bend3Q6PAL0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Bend3Q6PAL0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Bend3Q6PAL0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Bend3Q6PAL0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Bend3Q6PAL0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Bend3Q6PAL0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Bend3Q6PAL0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Bend3Q6PAL0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Bend3Q6PAL0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Bend3Q6PAL0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Bend3Q6PAL0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Bend3Q6PAL0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Bend3Q6PAL0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Bend3Q6PAL0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Bend3Q6PAL0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Bend3Q6PAL0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Bend3Q6PAL0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Bend3Q6PAL0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Bend3Q6PAL0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Bend3Q6PAL0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Bend3Q6PAL0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Bend3Q6PAL0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Bend3Q6PAL0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Bend3Q6PAL0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Bend3Q6PAL0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Bend3Q6PAL0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Bend3Q6PAL0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Bend3Q6PAL0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Bend3Q6PAL0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Bend3Q6PAL0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Bend3Q6PAL0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Bend3Q6PAL0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Bend3Q6PAL0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Bend3Q6PAL0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Bend3Q6PAL0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Bend3Q6PAL0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Bend3Q6PAL0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Bend3Q6PAL0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Bend3Q6PAL0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Bend3Q6PAL0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Bend3Q6PAL0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Bend3Q6PAL0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Bend3Q6PAL0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Bend3Q6PAL0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Bend3Q6PAL0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Bend3Q6PAL0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Bend3Q6PAL0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Bend3Q6PAL0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Bend3Q6PAL0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Bend3Q6PAL0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Bend3Q6PAL0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Bend3Q6PAL0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Bend3Q6PAL0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Bend3Q6PAL0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Bend3Q6PAL0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Bend3Q6PAL0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Bend3Q6PAL0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Bend3Q6PAL0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms