Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,42■■■■■ 5,34
Csf1rP09581 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,02■■■■■ 4,8
Csf1rP09581 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,25■■■■■ 4,67
Csf1rP09581 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,22■■■■■ 4,35
Csf1rP09581 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,79■■■■■ 4,28
Csf1rP09581 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Csf1rP09581 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,85■■■■■ 4,13
Csf1rP09581 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Csf1rP09581 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Csf1rP09581 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Csf1rP09581 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,3■■■■■ 4,04
Csf1rP09581 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,57■■■■□ 3,93
Csf1rP09581 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,21■■■■□ 3,87
Csf1rP09581 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,12■■■■□ 3,85
Csf1rP09581 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Csf1rP09581 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
Csf1rP09581 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Csf1rP09581 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Csf1rP09581 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,68■■■■□ 3,78
Csf1rP09581 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Csf1rP09581 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Csf1rP09581 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,42■■■■□ 3,74
Csf1rP09581 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Csf1rP09581 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,32■■■■□ 3,72
Csf1rP09581 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Csf1rP09581 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,79■■■■□ 3,64
Csf1rP09581 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Csf1rP09581 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,63■■■■□ 3,61
Csf1rP09581 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Csf1rP09581 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Csf1rP09581 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Csf1rP09581 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Csf1rP09581 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Csf1rP09581 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Csf1rP09581 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Csf1rP09581 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Csf1rP09581 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3,51
Csf1rP09581 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,99■■■■□ 3,51
Csf1rP09581 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,94■■■■□ 3,5
Csf1rP09581 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Csf1rP09581 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,64■■■■□ 3,46
Csf1rP09581 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,55■■■■□ 3,44
Csf1rP09581 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Csf1rP09581 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Csf1rP09581 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Csf1rP09581 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,37■■■■□ 3,41
Csf1rP09581 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Csf1rP09581 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Csf1rP09581 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Csf1rP09581 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Csf1rP09581 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,21■■■■□ 3,39
Csf1rP09581 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,17■■■■□ 3,38
Csf1rP09581 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Csf1rP09581 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Csf1rP09581 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Csf1rP09581 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Csf1rP09581 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Csf1rP09581 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Csf1rP09581 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Csf1rP09581 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Csf1rP09581 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Csf1rP09581 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Csf1rP09581 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Csf1rP09581 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,7■■■■□ 3,31
Csf1rP09581 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,66■■■■□ 3,3
Csf1rP09581 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Csf1rP09581 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Csf1rP09581 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Csf1rP09581 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Csf1rP09581 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Csf1rP09581 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Csf1rP09581 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Csf1rP09581 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Csf1rP09581 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Csf1rP09581 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Csf1rP09581 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Csf1rP09581 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Csf1rP09581 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Csf1rP09581 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Csf1rP09581 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Csf1rP09581 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Csf1rP09581 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Csf1rP09581 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Csf1rP09581 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Csf1rP09581 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Csf1rP09581 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Csf1rP09581 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
Csf1rP09581 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Csf1rP09581 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Csf1rP09581 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,7■■■■□ 3,15
Csf1rP09581 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,7■■■■□ 3,15
Csf1rP09581 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Csf1rP09581 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Csf1rP09581 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Csf1rP09581 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Csf1rP09581 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,6■■■■□ 3,13
Csf1rP09581 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Csf1rP09581 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Csf1rP09581 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Csf1rP09581 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms