Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.34■■■■■ 5.33
Ank1Q02357 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Ank1Q02357 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Ank1Q02357 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.26■■■■■ 4.35
Ank1Q02357 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
Ank1Q02357 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ank1Q02357 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Ank1Q02357 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Ank1Q02357 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Ank1Q02357 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
Ank1Q02357 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Ank1Q02357 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Ank1Q02357 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Ank1Q02357 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Ank1Q02357 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ank1Q02357 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ank1Q02357 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Ank1Q02357 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Ank1Q02357 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ank1Q02357 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ank1Q02357 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ank1Q02357 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ank1Q02357 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ank1Q02357 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ank1Q02357 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ank1Q02357 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ank1Q02357 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Ank1Q02357 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ank1Q02357 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ank1Q02357 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ank1Q02357 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ank1Q02357 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Ank1Q02357 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ank1Q02357 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Ank1Q02357 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ank1Q02357 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ank1Q02357 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ank1Q02357 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ank1Q02357 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ank1Q02357 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ank1Q02357 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ank1Q02357 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ank1Q02357 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ank1Q02357 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ank1Q02357 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ank1Q02357 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ank1Q02357 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Ank1Q02357 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ank1Q02357 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ank1Q02357 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ank1Q02357 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ank1Q02357 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ank1Q02357 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Ank1Q02357 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ank1Q02357 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ank1Q02357 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ank1Q02357 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ank1Q02357 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ank1Q02357 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ank1Q02357 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ank1Q02357 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Ank1Q02357 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Ank1Q02357 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ank1Q02357 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ank1Q02357 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ank1Q02357 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ank1Q02357 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ank1Q02357 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ank1Q02357 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ank1Q02357 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ank1Q02357 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ank1Q02357 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ank1Q02357 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ank1Q02357 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Ank1Q02357 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ank1Q02357 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ank1Q02357 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ank1Q02357 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ank1Q02357 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ank1Q02357 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ank1Q02357 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ank1Q02357 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ank1Q02357 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ank1Q02357 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Ank1Q02357 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Ank1Q02357 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ank1Q02357 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Ank1Q02357 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ank1Q02357 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ank1Q02357 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ank1Q02357 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ank1Q02357 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Ank1Q02357 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ank1Q02357 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ank1Q02357 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ank1Q02357 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ank1Q02357 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Ank1Q02357 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ank1Q02357 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ank1Q02357 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms