Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,34■■■■■ 5,33
Ank1Q02357 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,85■■■■■ 4,77
Ank1Q02357 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,83■■■■■ 4,61
Ank1Q02357 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42,26■■■■■ 4,35
Ank1Q02357 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,11■■■■■ 4,33
Ank1Q02357 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Ank1Q02357 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41,62■■■■■ 4,25
Ank1Q02357 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Ank1Q02357 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Ank1Q02357 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,11
Ank1Q02357 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,04
Ank1Q02357 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Ank1Q02357 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
Ank1Q02357 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,21■■■■■ 4,03
Ank1Q02357 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Ank1Q02357 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Ank1Q02357 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39,2■■■■□ 3,87
Ank1Q02357 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,11■■■■□ 3,85
Ank1Q02357 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Ank1Q02357 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Ank1Q02357 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,83■■■■□ 3,81
Ank1Q02357 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Ank1Q02357 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Ank1Q02357 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Ank1Q02357 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Ank1Q02357 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Ank1Q02357 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38,47■■■■□ 3,75
Ank1Q02357 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,45■■■■□ 3,75
Ank1Q02357 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Ank1Q02357 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Ank1Q02357 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Ank1Q02357 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38,35■■■■□ 3,73
Ank1Q02357 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Ank1Q02357 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,18■■■■□ 3,7
Ank1Q02357 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Ank1Q02357 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,01■■■■□ 3,68
Ank1Q02357 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Ank1Q02357 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Ank1Q02357 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,39■■■■□ 3,58
Ank1Q02357 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Ank1Q02357 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Ank1Q02357 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,16■■■■□ 3,54
Ank1Q02357 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Ank1Q02357 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Ank1Q02357 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Ank1Q02357 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Ank1Q02357 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,05■■■■□ 3,52
Ank1Q02357 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Ank1Q02357 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Ank1Q02357 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Ank1Q02357 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Ank1Q02357 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,81■■■■□ 3,48
Ank1Q02357 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,7■■■■□ 3,46
Ank1Q02357 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,65■■■■□ 3,46
Ank1Q02357 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Ank1Q02357 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,52■■■■□ 3,44
Ank1Q02357 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Ank1Q02357 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Ank1Q02357 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Ank1Q02357 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Ank1Q02357 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,28■■■■□ 3,4
Ank1Q02357 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,26■■■■□ 3,4
Ank1Q02357 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Ank1Q02357 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Ank1Q02357 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Ank1Q02357 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Ank1Q02357 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Ank1Q02357 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Ank1Q02357 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36,04■■■■□ 3,36
Ank1Q02357 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Ank1Q02357 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Ank1Q02357 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Ank1Q02357 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Ank1Q02357 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,84■■■■□ 3,33
Ank1Q02357 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Ank1Q02357 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,33
Ank1Q02357 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Ank1Q02357 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,81■■■■□ 3,32
Ank1Q02357 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Ank1Q02357 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Ank1Q02357 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Ank1Q02357 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Ank1Q02357 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Ank1Q02357 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,7■■■■□ 3,31
Ank1Q02357 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,3
Ank1Q02357 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Ank1Q02357 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,66■■■■□ 3,3
Ank1Q02357 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Ank1Q02357 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Ank1Q02357 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Ank1Q02357 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Ank1Q02357 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,45■■■■□ 3,27
Ank1Q02357 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Ank1Q02357 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Ank1Q02357 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Ank1Q02357 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Ank1Q02357 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,39■■■■□ 3,26
Ank1Q02357 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Ank1Q02357 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Ank1Q02357 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms