Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQP2

Ehd4, EH domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd4Q9EQP2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.02■■■■■ 5.28
Ehd4Q9EQP2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Ehd4Q9EQP2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ehd4Q9EQP2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
Ehd4Q9EQP2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Ehd4Q9EQP2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ehd4Q9EQP2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
Ehd4Q9EQP2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Ehd4Q9EQP2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Ehd4Q9EQP2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ehd4Q9EQP2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Ehd4Q9EQP2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Ehd4Q9EQP2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Ehd4Q9EQP2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ehd4Q9EQP2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ehd4Q9EQP2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ehd4Q9EQP2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Ehd4Q9EQP2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ehd4Q9EQP2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Ehd4Q9EQP2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ehd4Q9EQP2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Ehd4Q9EQP2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ehd4Q9EQP2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ehd4Q9EQP2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ehd4Q9EQP2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ehd4Q9EQP2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ehd4Q9EQP2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ehd4Q9EQP2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Ehd4Q9EQP2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
Ehd4Q9EQP2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ehd4Q9EQP2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ehd4Q9EQP2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ehd4Q9EQP2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ehd4Q9EQP2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ehd4Q9EQP2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Ehd4Q9EQP2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ehd4Q9EQP2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ehd4Q9EQP2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ehd4Q9EQP2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ehd4Q9EQP2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ehd4Q9EQP2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ehd4Q9EQP2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ehd4Q9EQP2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ehd4Q9EQP2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ehd4Q9EQP2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ehd4Q9EQP2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Ehd4Q9EQP2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ehd4Q9EQP2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ehd4Q9EQP2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Ehd4Q9EQP2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ehd4Q9EQP2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ehd4Q9EQP2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ehd4Q9EQP2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ehd4Q9EQP2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ehd4Q9EQP2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ehd4Q9EQP2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ehd4Q9EQP2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ehd4Q9EQP2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ehd4Q9EQP2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Ehd4Q9EQP2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ehd4Q9EQP2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Ehd4Q9EQP2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ehd4Q9EQP2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ehd4Q9EQP2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ehd4Q9EQP2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ehd4Q9EQP2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ehd4Q9EQP2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ehd4Q9EQP2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Ehd4Q9EQP2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ehd4Q9EQP2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ehd4Q9EQP2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ehd4Q9EQP2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Ehd4Q9EQP2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ehd4Q9EQP2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ehd4Q9EQP2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ehd4Q9EQP2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ehd4Q9EQP2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ehd4Q9EQP2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ehd4Q9EQP2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ehd4Q9EQP2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Ehd4Q9EQP2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ehd4Q9EQP2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ehd4Q9EQP2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ehd4Q9EQP2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ehd4Q9EQP2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ehd4Q9EQP2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Ehd4Q9EQP2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ehd4Q9EQP2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Ehd4Q9EQP2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ehd4Q9EQP2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ehd4Q9EQP2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ehd4Q9EQP2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ehd4Q9EQP2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ehd4Q9EQP2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Ehd4Q9EQP2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ehd4Q9EQP2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ehd4Q9EQP2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ehd4Q9EQP2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ehd4Q9EQP2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ehd4Q9EQP2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms