Protein–RNA interactions for Protein: Q5BU09

Eapp, E2F-associated phosphoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EappQ5BU09 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,09■■■■■ 5,29
EappQ5BU09 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,55■■■■■ 4,72
EappQ5BU09 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,89■■■■■ 4,62
EappQ5BU09 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,86■■■■■ 4,29
EappQ5BU09 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41,72■■■■■ 4,27
EappQ5BU09 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,9■■■■■ 4,14
EappQ5BU09 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
EappQ5BU09 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
EappQ5BU09 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
EappQ5BU09 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
EappQ5BU09 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,12■■■■■ 4,01
EappQ5BU09 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
EappQ5BU09 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
EappQ5BU09 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,18■■■■□ 3,86
EappQ5BU09 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
EappQ5BU09 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,02■■■■□ 3,84
EappQ5BU09 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,73■■■■□ 3,79
EappQ5BU09 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,68■■■■□ 3,78
EappQ5BU09 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,59■■■■□ 3,77
EappQ5BU09 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
EappQ5BU09 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
EappQ5BU09 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,41■■■■□ 3,74
EappQ5BU09 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,38■■■■□ 3,74
EappQ5BU09 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
EappQ5BU09 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
EappQ5BU09 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
EappQ5BU09 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
EappQ5BU09 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,02■■■■□ 3,68
EappQ5BU09 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,97■■■■□ 3,67
EappQ5BU09 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,97■■■■□ 3,67
EappQ5BU09 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,66
EappQ5BU09 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
EappQ5BU09 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,59■■■■□ 3,61
EappQ5BU09 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
EappQ5BU09 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
EappQ5BU09 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,44■■■■□ 3,58
EappQ5BU09 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
EappQ5BU09 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,19■■■■□ 3,54
EappQ5BU09 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
EappQ5BU09 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
EappQ5BU09 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,96■■■■□ 3,51
EappQ5BU09 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,85■■■■□ 3,49
EappQ5BU09 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,73■■■■□ 3,47
EappQ5BU09 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,72■■■■□ 3,47
EappQ5BU09 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
EappQ5BU09 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,64■■■■□ 3,46
EappQ5BU09 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,54■■■■□ 3,44
EappQ5BU09 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
EappQ5BU09 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
EappQ5BU09 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
EappQ5BU09 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
EappQ5BU09 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
EappQ5BU09 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
EappQ5BU09 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
EappQ5BU09 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
EappQ5BU09 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
EappQ5BU09 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,07■■■■□ 3,36
EappQ5BU09 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,05■■■■□ 3,36
EappQ5BU09 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,99■■■■□ 3,35
EappQ5BU09 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
EappQ5BU09 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
EappQ5BU09 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,83■■■■□ 3,33
EappQ5BU09 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
EappQ5BU09 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
EappQ5BU09 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,8■■■■□ 3,32
EappQ5BU09 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
EappQ5BU09 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
EappQ5BU09 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
EappQ5BU09 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,66■■■■□ 3,3
EappQ5BU09 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
EappQ5BU09 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,63■■■■□ 3,29
EappQ5BU09 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,62■■■■□ 3,29
EappQ5BU09 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,61■■■■□ 3,29
EappQ5BU09 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,53■■■■□ 3,28
EappQ5BU09 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
EappQ5BU09 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
EappQ5BU09 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
EappQ5BU09 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,44■■■■□ 3,26
EappQ5BU09 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
EappQ5BU09 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
EappQ5BU09 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
EappQ5BU09 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,32■■■■□ 3,25
EappQ5BU09 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,32■■■■□ 3,24
EappQ5BU09 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
EappQ5BU09 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
EappQ5BU09 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
EappQ5BU09 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
EappQ5BU09 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,2■■■■□ 3,23
EappQ5BU09 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
EappQ5BU09 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
EappQ5BU09 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
EappQ5BU09 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
EappQ5BU09 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
EappQ5BU09 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
EappQ5BU09 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
EappQ5BU09 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,99■■■■□ 3,19
EappQ5BU09 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,94■■■■□ 3,18
EappQ5BU09 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
EappQ5BU09 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,87■■■■□ 3,17
EappQ5BU09 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms