Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE3

Btaf1, B-TFIID TATA-box-binding protein-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btaf1E9QAE3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,23■■■■■ 5,31
Btaf1E9QAE3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,95■■■■■ 4,79
Btaf1E9QAE3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,93■■■■■ 4,62
Btaf1E9QAE3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,14■■■■■ 4,34
Btaf1E9QAE3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,79■■■■■ 4,28
Btaf1E9QAE3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41,02■■■■■ 4,16
Btaf1E9QAE3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Btaf1E9QAE3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Btaf1E9QAE3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Btaf1E9QAE3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Btaf1E9QAE3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,15■■■■■ 4,02
Btaf1E9QAE3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,37■■■■□ 3,89
Btaf1E9QAE3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,25■■■■□ 3,87
Btaf1E9QAE3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,96■■■■□ 3,83
Btaf1E9QAE3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,86■■■■□ 3,81
Btaf1E9QAE3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Btaf1E9QAE3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Btaf1E9QAE3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Btaf1E9QAE3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Btaf1E9QAE3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Btaf1E9QAE3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,43■■■■□ 3,74
Btaf1E9QAE3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Btaf1E9QAE3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,19■■■■□ 3,7
Btaf1E9QAE3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,19■■■■□ 3,7
Btaf1E9QAE3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Btaf1E9QAE3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Btaf1E9QAE3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,75■■■■□ 3,63
Btaf1E9QAE3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Btaf1E9QAE3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Btaf1E9QAE3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Btaf1E9QAE3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Btaf1E9QAE3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Btaf1E9QAE3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Btaf1E9QAE3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Btaf1E9QAE3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,17■■■■□ 3,54
Btaf1E9QAE3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3,51
Btaf1E9QAE3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Btaf1E9QAE3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,88■■■■□ 3,49
Btaf1E9QAE3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,71■■■■□ 3,47
Btaf1E9QAE3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Btaf1E9QAE3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,62■■■■□ 3,45
Btaf1E9QAE3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,54■■■■□ 3,44
Btaf1E9QAE3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Btaf1E9QAE3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,52■■■■□ 3,44
Btaf1E9QAE3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Btaf1E9QAE3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Btaf1E9QAE3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Btaf1E9QAE3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Btaf1E9QAE3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,2■■■■□ 3,38
Btaf1E9QAE3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Btaf1E9QAE3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
Btaf1E9QAE3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Btaf1E9QAE3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Btaf1E9QAE3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,94■■■■□ 3,34
Btaf1E9QAE3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Btaf1E9QAE3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,87■■■■□ 3,33
Btaf1E9QAE3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,83■■■■□ 3,33
Btaf1E9QAE3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,82■■■■□ 3,32
Btaf1E9QAE3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Btaf1E9QAE3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Btaf1E9QAE3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Btaf1E9QAE3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Btaf1E9QAE3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Btaf1E9QAE3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Btaf1E9QAE3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,29
Btaf1E9QAE3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,57■■■■□ 3,29
Btaf1E9QAE3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Btaf1E9QAE3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Btaf1E9QAE3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Btaf1E9QAE3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Btaf1E9QAE3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Btaf1E9QAE3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Btaf1E9QAE3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Btaf1E9QAE3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Btaf1E9QAE3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Btaf1E9QAE3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Btaf1E9QAE3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Btaf1E9QAE3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Btaf1E9QAE3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Btaf1E9QAE3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Btaf1E9QAE3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,99■■■■□ 3,19
Btaf1E9QAE3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Btaf1E9QAE3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Btaf1E9QAE3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Btaf1E9QAE3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Btaf1E9QAE3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Btaf1E9QAE3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Btaf1E9QAE3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Btaf1E9QAE3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Btaf1E9QAE3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Btaf1E9QAE3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Btaf1E9QAE3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Btaf1E9QAE3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Btaf1E9QAE3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Btaf1E9QAE3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Btaf1E9QAE3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,58■■■■□ 3,13
Btaf1E9QAE3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,54■■■■□ 3,12
Btaf1E9QAE3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,52■■■■□ 3,12
Btaf1E9QAE3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Btaf1E9QAE3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,4 ms