Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.28■■■■■ 5.32
Vil1Q62468 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Vil1Q62468 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Vil1Q62468 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Vil1Q62468 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Vil1Q62468 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Vil1Q62468 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Vil1Q62468 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Vil1Q62468 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Vil1Q62468 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Vil1Q62468 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Vil1Q62468 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Vil1Q62468 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Vil1Q62468 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Vil1Q62468 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Vil1Q62468 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Vil1Q62468 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Vil1Q62468 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Vil1Q62468 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Vil1Q62468 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Vil1Q62468 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Vil1Q62468 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Vil1Q62468 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Vil1Q62468 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Vil1Q62468 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Vil1Q62468 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Vil1Q62468 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Vil1Q62468 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Vil1Q62468 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Vil1Q62468 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Vil1Q62468 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Vil1Q62468 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Vil1Q62468 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Vil1Q62468 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Vil1Q62468 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Vil1Q62468 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Vil1Q62468 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Vil1Q62468 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Vil1Q62468 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Vil1Q62468 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Vil1Q62468 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Vil1Q62468 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Vil1Q62468 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Vil1Q62468 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Vil1Q62468 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Vil1Q62468 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Vil1Q62468 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Vil1Q62468 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Vil1Q62468 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Vil1Q62468 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Vil1Q62468 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Vil1Q62468 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Vil1Q62468 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Vil1Q62468 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Vil1Q62468 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Vil1Q62468 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Vil1Q62468 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Vil1Q62468 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Vil1Q62468 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Vil1Q62468 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Vil1Q62468 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Vil1Q62468 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Vil1Q62468 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Vil1Q62468 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Vil1Q62468 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Vil1Q62468 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Vil1Q62468 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Vil1Q62468 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Vil1Q62468 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Vil1Q62468 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Vil1Q62468 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Vil1Q62468 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Vil1Q62468 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Vil1Q62468 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Vil1Q62468 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Vil1Q62468 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Vil1Q62468 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Vil1Q62468 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Vil1Q62468 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Vil1Q62468 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Vil1Q62468 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Vil1Q62468 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Vil1Q62468 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Vil1Q62468 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Vil1Q62468 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Vil1Q62468 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Vil1Q62468 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Vil1Q62468 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Vil1Q62468 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Vil1Q62468 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Vil1Q62468 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Vil1Q62468 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Vil1Q62468 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Vil1Q62468 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Vil1Q62468 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Vil1Q62468 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Vil1Q62468 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Vil1Q62468 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Vil1Q62468 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Vil1Q62468 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms