Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,28■■■■■ 5,32
Vil1Q62468 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,88■■■■■ 4,78
Vil1Q62468 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,21■■■■■ 4,67
Vil1Q62468 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,09■■■■■ 4,33
Vil1Q62468 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,64■■■■■ 4,26
Vil1Q62468 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,13
Vil1Q62468 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,71■■■■■ 4,11
Vil1Q62468 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,65■■■■■ 4,1
Vil1Q62468 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Vil1Q62468 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
Vil1Q62468 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Vil1Q62468 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,46■■■■□ 3,91
Vil1Q62468 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,08■■■■□ 3,85
Vil1Q62468 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Vil1Q62468 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Vil1Q62468 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Vil1Q62468 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Vil1Q62468 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,61■■■■□ 3,77
Vil1Q62468 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Vil1Q62468 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,34■■■■□ 3,73
Vil1Q62468 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Vil1Q62468 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Vil1Q62468 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,3■■■■□ 3,72
Vil1Q62468 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Vil1Q62468 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Vil1Q62468 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,54■■■■□ 3,6
Vil1Q62468 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Vil1Q62468 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Vil1Q62468 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Vil1Q62468 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Vil1Q62468 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,24■■■■□ 3,55
Vil1Q62468 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,22■■■■□ 3,55
Vil1Q62468 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37,04■■■■□ 3,52
Vil1Q62468 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Vil1Q62468 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Vil1Q62468 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,95■■■■□ 3,51
Vil1Q62468 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Vil1Q62468 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Vil1Q62468 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Vil1Q62468 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,7■■■■□ 3,47
Vil1Q62468 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,61■■■■□ 3,45
Vil1Q62468 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36,48■■■■□ 3,43
Vil1Q62468 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Vil1Q62468 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Vil1Q62468 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Vil1Q62468 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36,26■■■■□ 3,4
Vil1Q62468 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Vil1Q62468 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Vil1Q62468 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Vil1Q62468 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,11■■■■□ 3,37
Vil1Q62468 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Vil1Q62468 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Vil1Q62468 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Vil1Q62468 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Vil1Q62468 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Vil1Q62468 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Vil1Q62468 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Vil1Q62468 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Vil1Q62468 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Vil1Q62468 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Vil1Q62468 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,74■■■■□ 3,31
Vil1Q62468 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Vil1Q62468 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Vil1Q62468 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Vil1Q62468 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Vil1Q62468 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Vil1Q62468 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Vil1Q62468 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Vil1Q62468 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Vil1Q62468 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Vil1Q62468 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Vil1Q62468 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Vil1Q62468 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Vil1Q62468 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Vil1Q62468 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Vil1Q62468 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
Vil1Q62468 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Vil1Q62468 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Vil1Q62468 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34,95■■■■□ 3,19
Vil1Q62468 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Vil1Q62468 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Vil1Q62468 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Vil1Q62468 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
Vil1Q62468 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Vil1Q62468 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Vil1Q62468 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Vil1Q62468 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Vil1Q62468 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Vil1Q62468 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,54■■■■□ 3,12
Vil1Q62468 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Vil1Q62468 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Vil1Q62468 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Vil1Q62468 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Vil1Q62468 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Vil1Q62468 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Vil1Q62468 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Vil1Q62468 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Vil1Q62468 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Vil1Q62468 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Vil1Q62468 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms