Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
Myo3bQ1EG27 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Myo3bQ1EG27 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Myo3bQ1EG27 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Myo3bQ1EG27 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Myo3bQ1EG27 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
Myo3bQ1EG27 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Myo3bQ1EG27 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Myo3bQ1EG27 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Myo3bQ1EG27 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Myo3bQ1EG27 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Myo3bQ1EG27 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Myo3bQ1EG27 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Myo3bQ1EG27 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Myo3bQ1EG27 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Myo3bQ1EG27 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
Myo3bQ1EG27 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Myo3bQ1EG27 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Myo3bQ1EG27 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Myo3bQ1EG27 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Myo3bQ1EG27 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Myo3bQ1EG27 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Myo3bQ1EG27 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Myo3bQ1EG27 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Myo3bQ1EG27 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Myo3bQ1EG27 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Myo3bQ1EG27 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Myo3bQ1EG27 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Myo3bQ1EG27 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Myo3bQ1EG27 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Myo3bQ1EG27 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Myo3bQ1EG27 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Myo3bQ1EG27 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Myo3bQ1EG27 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Myo3bQ1EG27 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Myo3bQ1EG27 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Myo3bQ1EG27 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Myo3bQ1EG27 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Myo3bQ1EG27 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Myo3bQ1EG27 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Myo3bQ1EG27 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Myo3bQ1EG27 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Myo3bQ1EG27 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Myo3bQ1EG27 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Myo3bQ1EG27 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Myo3bQ1EG27 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Myo3bQ1EG27 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Myo3bQ1EG27 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Myo3bQ1EG27 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Myo3bQ1EG27 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Myo3bQ1EG27 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Myo3bQ1EG27 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Myo3bQ1EG27 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Myo3bQ1EG27 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Myo3bQ1EG27 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Myo3bQ1EG27 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Myo3bQ1EG27 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Myo3bQ1EG27 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Myo3bQ1EG27 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Myo3bQ1EG27 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Myo3bQ1EG27 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Myo3bQ1EG27 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Myo3bQ1EG27 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Myo3bQ1EG27 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Myo3bQ1EG27 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Myo3bQ1EG27 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Myo3bQ1EG27 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Myo3bQ1EG27 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Myo3bQ1EG27 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Myo3bQ1EG27 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Myo3bQ1EG27 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Myo3bQ1EG27 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Myo3bQ1EG27 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Myo3bQ1EG27 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Myo3bQ1EG27 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Myo3bQ1EG27 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Myo3bQ1EG27 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Myo3bQ1EG27 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Myo3bQ1EG27 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Myo3bQ1EG27 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Myo3bQ1EG27 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Myo3bQ1EG27 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Myo3bQ1EG27 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Myo3bQ1EG27 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Myo3bQ1EG27 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Myo3bQ1EG27 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Myo3bQ1EG27 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Myo3bQ1EG27 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Myo3bQ1EG27 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Myo3bQ1EG27 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Myo3bQ1EG27 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Myo3bQ1EG27 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Myo3bQ1EG27 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Myo3bQ1EG27 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Myo3bQ1EG27 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Myo3bQ1EG27 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Myo3bQ1EG27 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Myo3bQ1EG27 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Myo3bQ1EG27 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Myo3bQ1EG27 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms