Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUS4

Gja10, Gap junction alpha-10 protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja10Q9WUS4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.31■■■■■ 5.32
Gja10Q9WUS4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
Gja10Q9WUS4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Gja10Q9WUS4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
Gja10Q9WUS4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Gja10Q9WUS4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
Gja10Q9WUS4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Gja10Q9WUS4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Gja10Q9WUS4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Gja10Q9WUS4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Gja10Q9WUS4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Gja10Q9WUS4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Gja10Q9WUS4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Gja10Q9WUS4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Gja10Q9WUS4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Gja10Q9WUS4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
Gja10Q9WUS4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Gja10Q9WUS4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Gja10Q9WUS4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Gja10Q9WUS4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Gja10Q9WUS4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Gja10Q9WUS4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Gja10Q9WUS4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Gja10Q9WUS4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Gja10Q9WUS4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Gja10Q9WUS4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Gja10Q9WUS4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Gja10Q9WUS4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Gja10Q9WUS4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Gja10Q9WUS4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Gja10Q9WUS4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Gja10Q9WUS4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Gja10Q9WUS4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Gja10Q9WUS4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Gja10Q9WUS4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Gja10Q9WUS4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Gja10Q9WUS4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Gja10Q9WUS4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Gja10Q9WUS4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Gja10Q9WUS4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Gja10Q9WUS4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Gja10Q9WUS4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Gja10Q9WUS4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Gja10Q9WUS4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Gja10Q9WUS4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Gja10Q9WUS4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Gja10Q9WUS4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Gja10Q9WUS4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Gja10Q9WUS4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Gja10Q9WUS4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gja10Q9WUS4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Gja10Q9WUS4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Gja10Q9WUS4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Gja10Q9WUS4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gja10Q9WUS4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gja10Q9WUS4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gja10Q9WUS4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Gja10Q9WUS4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Gja10Q9WUS4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Gja10Q9WUS4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Gja10Q9WUS4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Gja10Q9WUS4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Gja10Q9WUS4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Gja10Q9WUS4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Gja10Q9WUS4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Gja10Q9WUS4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Gja10Q9WUS4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Gja10Q9WUS4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Gja10Q9WUS4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Gja10Q9WUS4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gja10Q9WUS4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Gja10Q9WUS4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Gja10Q9WUS4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Gja10Q9WUS4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gja10Q9WUS4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gja10Q9WUS4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Gja10Q9WUS4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Gja10Q9WUS4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Gja10Q9WUS4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gja10Q9WUS4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gja10Q9WUS4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Gja10Q9WUS4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Gja10Q9WUS4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Gja10Q9WUS4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gja10Q9WUS4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Gja10Q9WUS4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gja10Q9WUS4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gja10Q9WUS4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Gja10Q9WUS4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Gja10Q9WUS4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gja10Q9WUS4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Gja10Q9WUS4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gja10Q9WUS4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Gja10Q9WUS4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Gja10Q9WUS4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Gja10Q9WUS4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Gja10Q9WUS4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Gja10Q9WUS4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Gja10Q9WUS4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Gja10Q9WUS4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms