Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.49■■■■■ 5.35
Col24a1Q30D77 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Col24a1Q30D77 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Col24a1Q30D77 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
Col24a1Q30D77 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
Col24a1Q30D77 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Col24a1Q30D77 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Col24a1Q30D77 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
Col24a1Q30D77 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Col24a1Q30D77 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Col24a1Q30D77 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Col24a1Q30D77 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Col24a1Q30D77 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Col24a1Q30D77 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Col24a1Q30D77 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Col24a1Q30D77 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
Col24a1Q30D77 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Col24a1Q30D77 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Col24a1Q30D77 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Col24a1Q30D77 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Col24a1Q30D77 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Col24a1Q30D77 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Col24a1Q30D77 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Col24a1Q30D77 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Col24a1Q30D77 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Col24a1Q30D77 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Col24a1Q30D77 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Col24a1Q30D77 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Col24a1Q30D77 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Col24a1Q30D77 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Col24a1Q30D77 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Col24a1Q30D77 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Col24a1Q30D77 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Col24a1Q30D77 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Col24a1Q30D77 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Col24a1Q30D77 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Col24a1Q30D77 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Col24a1Q30D77 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Col24a1Q30D77 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Col24a1Q30D77 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Col24a1Q30D77 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Col24a1Q30D77 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Col24a1Q30D77 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Col24a1Q30D77 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Col24a1Q30D77 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Col24a1Q30D77 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Col24a1Q30D77 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Col24a1Q30D77 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Col24a1Q30D77 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Col24a1Q30D77 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Col24a1Q30D77 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Col24a1Q30D77 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Col24a1Q30D77 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Col24a1Q30D77 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Col24a1Q30D77 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Col24a1Q30D77 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Col24a1Q30D77 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Col24a1Q30D77 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Col24a1Q30D77 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Col24a1Q30D77 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Col24a1Q30D77 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Col24a1Q30D77 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Col24a1Q30D77 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Col24a1Q30D77 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Col24a1Q30D77 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Col24a1Q30D77 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Col24a1Q30D77 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col24a1Q30D77 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Col24a1Q30D77 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Col24a1Q30D77 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Col24a1Q30D77 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Col24a1Q30D77 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Col24a1Q30D77 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Col24a1Q30D77 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Col24a1Q30D77 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Col24a1Q30D77 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Col24a1Q30D77 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col24a1Q30D77 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Col24a1Q30D77 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Col24a1Q30D77 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Col24a1Q30D77 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Col24a1Q30D77 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Col24a1Q30D77 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Col24a1Q30D77 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Col24a1Q30D77 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Col24a1Q30D77 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Col24a1Q30D77 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col24a1Q30D77 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Col24a1Q30D77 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Col24a1Q30D77 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Col24a1Q30D77 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Col24a1Q30D77 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Col24a1Q30D77 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col24a1Q30D77 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Col24a1Q30D77 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Col24a1Q30D77 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Col24a1Q30D77 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Col24a1Q30D77 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Col24a1Q30D77 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Col24a1Q30D77 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms