Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,02■■■■■ 5,28
BcanQ61361 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,44■■■■■ 4,7
BcanQ61361 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
BcanQ61361 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,88■■■■■ 4,29
BcanQ61361 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41,61■■■■■ 4,25
BcanQ61361 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
BcanQ61361 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,93■■■■■ 4,14
BcanQ61361 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
BcanQ61361 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
BcanQ61361 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
BcanQ61361 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
BcanQ61361 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,06■■■■■ 4
BcanQ61361 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
BcanQ61361 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,68■■■■□ 3,94
BcanQ61361 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
BcanQ61361 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
BcanQ61361 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,89■■■■□ 3,82
BcanQ61361 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,67■■■■□ 3,78
BcanQ61361 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,66■■■■□ 3,78
BcanQ61361 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
BcanQ61361 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,63■■■■□ 3,77
BcanQ61361 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
BcanQ61361 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,44■■■■□ 3,74
BcanQ61361 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
BcanQ61361 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
BcanQ61361 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
BcanQ61361 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
BcanQ61361 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
BcanQ61361 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
BcanQ61361 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,92■■■■□ 3,66
BcanQ61361 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
BcanQ61361 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
BcanQ61361 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
BcanQ61361 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,86■■■■□ 3,65
BcanQ61361 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,8■■■■□ 3,64
BcanQ61361 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,72■■■■□ 3,63
BcanQ61361 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
BcanQ61361 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,12■■■■□ 3,53
BcanQ61361 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,07■■■■□ 3,52
BcanQ61361 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
BcanQ61361 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,92■■■■□ 3,5
BcanQ61361 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
BcanQ61361 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
BcanQ61361 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
BcanQ61361 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
BcanQ61361 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,67■■■■□ 3,46
BcanQ61361 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
BcanQ61361 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,62■■■■□ 3,45
BcanQ61361 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,58■■■■□ 3,45
BcanQ61361 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,49■■■■□ 3,43
BcanQ61361 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,38■■■■□ 3,41
BcanQ61361 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
BcanQ61361 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
BcanQ61361 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
BcanQ61361 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,26■■■■□ 3,4
BcanQ61361 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,17■■■■□ 3,38
BcanQ61361 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
BcanQ61361 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
BcanQ61361 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
BcanQ61361 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36,04■■■■□ 3,36
BcanQ61361 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
BcanQ61361 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
BcanQ61361 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
BcanQ61361 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
BcanQ61361 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
BcanQ61361 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
BcanQ61361 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
BcanQ61361 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,65■■■■□ 3,3
BcanQ61361 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,65■■■■□ 3,3
BcanQ61361 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,64■■■■□ 3,3
BcanQ61361 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,63■■■■□ 3,29
BcanQ61361 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,61■■■■□ 3,29
BcanQ61361 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
BcanQ61361 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
BcanQ61361 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
BcanQ61361 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
BcanQ61361 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,54■■■■□ 3,28
BcanQ61361 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,44■■■■□ 3,26
BcanQ61361 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
BcanQ61361 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
BcanQ61361 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
BcanQ61361 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
BcanQ61361 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
BcanQ61361 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
BcanQ61361 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,36■■■■□ 3,25
BcanQ61361 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
BcanQ61361 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
BcanQ61361 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,3■■■■□ 3,24
BcanQ61361 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
BcanQ61361 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
BcanQ61361 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
BcanQ61361 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
BcanQ61361 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
BcanQ61361 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
BcanQ61361 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35,12■■■■□ 3,21
BcanQ61361 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,09■■■■□ 3,21
BcanQ61361 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,09■■■■□ 3,21
BcanQ61361 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,99■■■■□ 3,19
BcanQ61361 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
BcanQ61361 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
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