Protein–RNA interactions for Protein: P51432

Plcb3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb3P51432 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
Plcb3P51432 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Plcb3P51432 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Plcb3P51432 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
Plcb3P51432 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Plcb3P51432 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Plcb3P51432 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
Plcb3P51432 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Plcb3P51432 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Plcb3P51432 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Plcb3P51432 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Plcb3P51432 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Plcb3P51432 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Plcb3P51432 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Plcb3P51432 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Plcb3P51432 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Plcb3P51432 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Plcb3P51432 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Plcb3P51432 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Plcb3P51432 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Plcb3P51432 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Plcb3P51432 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Plcb3P51432 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Plcb3P51432 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Plcb3P51432 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Plcb3P51432 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Plcb3P51432 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Plcb3P51432 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Plcb3P51432 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Plcb3P51432 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Plcb3P51432 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Plcb3P51432 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Plcb3P51432 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Plcb3P51432 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Plcb3P51432 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Plcb3P51432 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Plcb3P51432 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Plcb3P51432 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Plcb3P51432 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Plcb3P51432 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Plcb3P51432 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Plcb3P51432 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Plcb3P51432 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Plcb3P51432 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Plcb3P51432 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Plcb3P51432 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Plcb3P51432 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Plcb3P51432 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Plcb3P51432 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Plcb3P51432 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Plcb3P51432 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Plcb3P51432 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Plcb3P51432 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Plcb3P51432 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Plcb3P51432 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Plcb3P51432 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Plcb3P51432 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Plcb3P51432 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Plcb3P51432 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Plcb3P51432 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Plcb3P51432 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Plcb3P51432 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Plcb3P51432 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Plcb3P51432 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Plcb3P51432 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Plcb3P51432 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Plcb3P51432 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Plcb3P51432 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Plcb3P51432 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Plcb3P51432 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Plcb3P51432 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Plcb3P51432 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Plcb3P51432 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Plcb3P51432 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Plcb3P51432 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Plcb3P51432 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Plcb3P51432 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Plcb3P51432 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Plcb3P51432 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Plcb3P51432 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Plcb3P51432 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Plcb3P51432 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Plcb3P51432 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Plcb3P51432 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Plcb3P51432 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Plcb3P51432 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Plcb3P51432 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Plcb3P51432 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Plcb3P51432 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Plcb3P51432 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Plcb3P51432 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Plcb3P51432 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Plcb3P51432 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Plcb3P51432 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Plcb3P51432 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Plcb3P51432 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Plcb3P51432 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Plcb3P51432 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Plcb3P51432 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Plcb3P51432 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms