Protein–RNA interactions for Protein: P51432

Plcb3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb3P51432 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,78■■■■■ 5,24
Plcb3P51432 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44,15■■■■■ 4,66
Plcb3P51432 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,53■■■■■ 4,56
Plcb3P51432 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,82■■■■■ 4,29
Plcb3P51432 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41,42■■■■■ 4,22
Plcb3P51432 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Plcb3P51432 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,95■■■■■ 4,15
Plcb3P51432 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Plcb3P51432 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Plcb3P51432 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Plcb3P51432 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Plcb3P51432 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,91■■■■□ 3,98
Plcb3P51432 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,9■■■■□ 3,98
Plcb3P51432 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Plcb3P51432 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Plcb3P51432 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Plcb3P51432 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,77■■■■□ 3,8
Plcb3P51432 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Plcb3P51432 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Plcb3P51432 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,53■■■■□ 3,76
Plcb3P51432 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Plcb3P51432 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38,32■■■■□ 3,72
Plcb3P51432 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Plcb3P51432 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Plcb3P51432 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Plcb3P51432 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Plcb3P51432 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Plcb3P51432 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38,01■■■■□ 3,67
Plcb3P51432 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Plcb3P51432 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Plcb3P51432 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,9■■■■□ 3,66
Plcb3P51432 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Plcb3P51432 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Plcb3P51432 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Plcb3P51432 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Plcb3P51432 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,65■■■■□ 3,62
Plcb3P51432 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Plcb3P51432 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Plcb3P51432 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,01■■■■□ 3,52
Plcb3P51432 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Plcb3P51432 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Plcb3P51432 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Plcb3P51432 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,49
Plcb3P51432 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,82■■■■□ 3,48
Plcb3P51432 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,68■■■■□ 3,46
Plcb3P51432 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Plcb3P51432 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Plcb3P51432 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,61■■■■□ 3,45
Plcb3P51432 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36,59■■■■□ 3,45
Plcb3P51432 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,52■■■■□ 3,44
Plcb3P51432 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Plcb3P51432 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Plcb3P51432 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Plcb3P51432 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Plcb3P51432 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Plcb3P51432 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Plcb3P51432 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Plcb3P51432 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36,04■■■■□ 3,36
Plcb3P51432 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Plcb3P51432 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Plcb3P51432 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Plcb3P51432 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Plcb3P51432 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Plcb3P51432 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Plcb3P51432 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Plcb3P51432 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Plcb3P51432 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Plcb3P51432 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Plcb3P51432 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Plcb3P51432 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Plcb3P51432 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Plcb3P51432 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Plcb3P51432 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Plcb3P51432 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
Plcb3P51432 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
Plcb3P51432 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Plcb3P51432 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Plcb3P51432 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Plcb3P51432 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Plcb3P51432 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Plcb3P51432 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Plcb3P51432 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Plcb3P51432 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Plcb3P51432 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Plcb3P51432 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Plcb3P51432 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Plcb3P51432 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Plcb3P51432 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,19■■■■□ 3,22
Plcb3P51432 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Plcb3P51432 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Plcb3P51432 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Plcb3P51432 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Plcb3P51432 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Plcb3P51432 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Plcb3P51432 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Plcb3P51432 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,99■■■■□ 3,19
Plcb3P51432 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Plcb3P51432 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,94■■■■□ 3,18
Plcb3P51432 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Plcb3P51432 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,9■■■■□ 3,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms