RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	SPL2	P38839	148 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	YIR042C	P40586	236 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	YFH7	P43591	353 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	PIP2	P52960	996 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	MSH6	Q03834	1242 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	INM2	Q05533	292 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	TAH18	Q12181	623 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
TRM10	YOL093W	FLO1	P32768	1537 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	HXT13	P39924	564 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	KIN4	Q01919	800 aa		5.64	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	GSC2	P40989	1895 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	PCT1	P13259	424 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	PEP3	P27801	918 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	HXT17	P53631	564 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	ARP5	P53946	755 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	TIM50	Q02776	476 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	TRS120	Q04183	1289 aa		5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	NEO1	P40527	1151 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	GSM1	P42950	618 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	RSC4	Q02206	625 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.62	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	IMP2'	P32351	346 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	YPT53	P36019	220 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	GRX7	P38068	203 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	LAM4	P38800	1345 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.61	□□□□□ -1.51	not detected
TRM10	YOL093W	PES4	P39684	611 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	ALG2	P43636	503 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	YKE2	P52553	114 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	PEX14	P53112	341 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	PIB2	P53191	635 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.61	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	NFS1	P25374	497 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	AFG2	P32794	780 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	ERP5	P38819	212 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	RTS1	P38903	757 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	YJR124C	P47159	448 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	YNL011C	P53980	444 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	COG8	Q04632	607 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	PSK2	Q08217	1101 aa		5.6	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	SNF3	P10870	884 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	SEC20	P28791	383 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	BUD6	P41697	788 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	CDC55	Q00362	526 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	EST2	Q06163	884 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	TOS4	Q06266	489 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	GLO4	Q12320	285 aa		5.59	□□□□□ -1.51
TRM10	YOL093W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	BIK1	P11709	440 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	RER2	P35196	286 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	GPT2	P36148	743 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	YHL017W	P38745	532 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	FET4	P40988	552 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	VPS20	Q04272	221 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	BSC2	Q05611	235 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	YOR223W	Q12015	292 aa		5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	FLO11	P08640	1367 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	HVG1	P0CE11	249 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.57	□□□□□ -1.52	not detected
TRM10	YOL093W	OPY1	P38271	328 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	VPS8	P39702	1274 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	MDJ2	P42834	146 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	PPM2	Q08282	695 aa		5.57	□□□□□ -1.52
TRM10	YOL093W	PCL8	Q08966	492 aa		5.57	□□□□□ -1.52

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