RNA–Protein interactions for RNA: YHR052W

CIC1, Transcript of Essential protein that interacts with proteasome components, yeast

Gene CIC1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIC1	YHR052W	LAS17	Q12446	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	AGP1	P25376	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	YKL151C	P36059	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	YAP1801	P38856	637 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	CWC24	P53769	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	MDM38	Q08179	573 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	OSW2	Q12202	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	SRP101	P32916	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	YKL069W	P36088	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	YGR012W	P53206	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	OPI10	Q08202	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	NPC2	Q12408	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	GIC1	P38785	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	MBP1	P39678	833 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
CIC1	YHR052W	SRT1	Q03175	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	CDA1	Q06702	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	SPE1	P08432	466 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	PRI2	P20457	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	FUN30	P31380	1131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	VBA5	P36172	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	SUL1	P38359	859 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	BUL1	P48524	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	SHE9	Q04172	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CIC1	YHR052W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	NPP2	P39997	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	TMN2	Q04562	672 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	KAR4	P25583	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	VAC8	P39968	578 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	ATF1	P40353	525 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
CIC1	YHR052W	STB4	P50104	949 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	NCS6	P53088	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	ENB1	Q08299	606 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	MRP8	P35719	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	CCC2	P38995	1004 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	RPC82	P32349	654 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	SFB2	P53953	876 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	BDF2	Q07442	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	MCH5	Q08777	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	HSF1	P10961	833 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	PBY1	P38254	753 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	YER158C	P40095	573 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	STU2	P46675	888 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	GYP7	P48365	746 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CIC1	YHR052W	ERG4	P25340	473 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	STE5	P32917	917 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	IRR1	P40541	1150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	PPH3	P32345	308 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	AFR1	P33304	620 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	KTR4	P38131	464 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	MUK1	Q02866	612 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	NPP1	P25353	742 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	ATG19	P35193	415 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	SIT1	P39980	628 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	PFD1	P46988	109 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	IRC10	Q08118	586 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	TRM13	Q12383	476 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	YKE2	P52553	114 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	TPO2	P53283	614 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	OMS1	Q06668	471 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	GUP2	Q08929	609 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	ACF2	Q12168	779 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	YBR184W	P38299	523 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	SNM1	P40993	198 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CIC1	YHR052W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69

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