RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	UBS1	P38290	277 aa		1.13	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	1.13	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	RNT1	Q02555	471 aa		1.13	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	COQ11	Q05892	277 aa		1.13	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	GNT1	Q12096	491 aa		1.13	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	TMT1	P32643	299 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SEC8	P32855	1065 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	YGR012W	P53206	393 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	HRQ1	Q05549	1077 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	MCD1	Q12158	566 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	ALG7	P07286	448 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SPE1	P08432	466 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	MET10	P39692	1035 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SRT1	Q03175	343 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	MDM38	Q08179	573 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	OSW2	Q12202	724 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	GPR1	Q12361	961 aa		1.12	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	ATG19	P35193	415 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	IPL1	P38991	367 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	FYV10	P40492	516 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SDS3	P40505	327 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	IMO32	P53219	342 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	YGR053C	P53234	283 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	MRPS35	P53292	345 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	BNR1	P40450	1375 aa		1.11	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	HSF1	P10961	833 aa		1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	CCC2	P38995	1004 aa		1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	MRPS18	P42847	217 aa		1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SEC5	P89102	971 aa		1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	PPZ2	P33329	710 aa		1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	GLO1	P50107	326 aa		1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SPR28	Q04921	423 aa		1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	FUN30	P31380	1131 aa		1.1	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SRP101	P32916	621 aa		1.09	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	CTF13	P35203	478 aa		1.09	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	YBR053C	P38235	358 aa		1.09	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	ESC2	Q06340	456 aa		1.09	□□□□□ -2.23
CSE1	YGL238W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	CDC34	P14682	295 aa		1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	NPP1	P25353	742 aa		1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	PPS1	P38148	807 aa		1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	TDP1	P38319	544 aa		1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	YHL017W	P38745	532 aa		1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	TAH11	P47112	604 aa		1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.09	□□□□□ -2.24	not detected
CSE1	YGL238W	THI7	Q05998	598 aa		1.09	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	MCM7	P38132	845 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	DAS1	P47005	663 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	MRL1	Q06815	381 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	RTT10	Q08924	1013 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	YUR1	P26725	428 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	MCM2	P29469	868 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	SFB2	P53953	876 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	ARO10	Q06408	635 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	FRE5	Q08908	694 aa		1.08	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	SED4	P25365	1065 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	LYP1	P32487	611 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	CTF8	P38877	133 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	RKM4	Q12504	494 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	EMP70	P32802	667 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.07	□□□□□ -2.24	not detected
CSE1	YGL238W	GYP7	P48365	746 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	SCS3	P53012	380 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	ADY4	Q05955	493 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	CIR2	Q08822	631 aa		1.07	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	CDC43	P18898	376 aa		1.06	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	RAD27	P26793	382 aa		1.06	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	SIT1	P39980	628 aa		1.06	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	YIL166C	P40445	542 aa		1.06	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	TYW3	P53177	273 aa		1.06	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	1.06	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	1.06	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	GEP3	Q08622	556 aa		1.06	□□□□□ -2.24
CSE1	YGL238W	TAF3	Q12297	353 aa		1.06	□□□□□ -2.24

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